| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 600 total aligned reads displayed.
GTTGTCCTTATGATAACGCAGTTGCGGAAGCAACGATGAAAGCAATGAAAACCGAATTTGTAAAACAAATGCAATTTGAAAACTTAGAACAGTTAGAAACAGAATTATTTGATTATGTAAATTGGTACAACAATTTTAGACCACATTCTTCATTACAGTATTTGACGCCAGTGGCATTTAAAAATCTACACATGAAAACTGTCTAAAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_31/1000‑1209 | tGTCCTTATGATAACGCAGTTGCGGAAGCAACGATGAAAGCAATGAAAACCGAATTTGTAAAACAAATGCAATTTGAAAACTTAGAACAGTTAGAAACAGAATTATTTGATTATGTAAATTGGTACAACAATTTTAGACCACATTCTTCa < 1:92576/150‑1 (MQ=255) gTCCTTATGATAACGCAGTTGCGGAAGCAACGATGAAAGCAATGAAAACCGAATTTGTAAAACAAATGCAATTTGAAAACTTAGAACAGTTAGAAACAGAATTATTTGATTATGTAAATTGGTACAACAATTTTAGACCACATTCTTCAt < 1:3468880/150‑1 (MQ=255) gTCCTTATGATAACGCAGTTGCGGAAGCAACGATGAAAGCAATGAAAACCGAATTTGTAAAACAAATGCAATTTGAAAACTTAGAACAGTTAGAAACAGAATTATTTGATTATGTAAATTGGTACAACAATTTTAGACCACATTCTTCAt > 1:396760/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |