| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_16 | = 244 | 97 (0.640) | 91 (0.900) +TTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAAT |
52/232 | 1.1 | 70.7% | noncoding (73/76 nt) | Xen36_02457 | tRNA‑Lys(ttt) |
| ? | Xen36_34 | = 443 | 0 (0.000) | noncoding (1/75 nt) | Xen36_02623 | tRNA‑Gly(gcc) | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
AACCGGTACGGTGATCTCTCACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_34/294‑443 | aaCCGGTACGGTGATCTCTCACCGCAGGATTTTAATTTCTGTGTGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGc < 1:2282808/150‑1 (MQ=255)aaCCGGTACGGTGATCTCTCACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGc < 1:1493314/150‑1 (MQ=255) aCCGGTACGGTGATCTCTCACCACAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCa > 1:2164794‑M2/1‑149 (MQ=255) ccGGTACGGTGATCTCTCACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCat < 1:1678212‑M2/150‑3 (MQ=255) cGGTGATCTCTCACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattatttt > 1:642390‑M2/1‑142 (MQ=255) cGGTGATCTCTCACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattatttt > 1:2051139‑M2/1‑142 (MQ=255) cGGTGATCTCTCACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACCACTTCTGCattatttt > 1:828078‑M2/1‑142 (MQ=255) ggTGATCTCTCACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttg > 1:929517‑M2/1‑141 (MQ=255) gTGATCTCTCACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgc > 1:1163720‑M2/1‑140 (MQ=255) gTGATCTCTCACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgc > 1:1882401‑M2/1‑140 (MQ=255) gTGATCTCTCACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgc < 1:1314268‑M2/150‑11 (MQ=255) tGATCTCTCACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgct < 1:2161395‑M2/150‑12 (MQ=255) tctctcACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCCGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaa > 1:1218832‑M2/1‑136 (MQ=255) 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tAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgta < 1:2173778‑M2/150‑33 (MQ=255) tAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgta > 1:3255885‑M2/1‑118 (MQ=255) gTCCTGTTCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGGACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatg > 1:234922‑M2/1‑115 (MQ=255) ccTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgag > 1:2682479‑M2/1‑113 (MQ=255) ccTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgag > 1:2682478‑M2/1‑113 (MQ=255) ccTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgag > 1:379128‑M2/1‑113 (MQ=255) tgtgAGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagcc > 1:833022‑M2/1‑111 (MQ=255) cTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTGCCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagccatagagg > 1:2827377‑M2/1‑104 (MQ=255) gCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagccatagaggat < 1:3611096‑M2/150‑49 (MQ=255) gCCAGTTCCGCCACCCCGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaactaaatcgtaatgagccatagaggat < 1:490318‑M2/150‑49 (MQ=255) 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cccGGCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagccatagaggattcgaacctctgacc > 1:484388‑M2/1‑88 (MQ=255) gCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagccatagaggattcgaacatctgaccctct < 1:146455‑M2/150‑67 (MQ=255) gCAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagccatagaggattcgaacatctgaccctct < 1:2609170‑M2/150‑67 (MQ=255) cAAAATAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagtcatagaggattcgaacctctgaccctctg > 1:1641929‑M2/1‑83 (MQ=255) aaaTAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagccatagaggattcgaacctctgaccctctgat > 1:165866‑M2/1‑81 (MQ=255) aaaTAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagccatagaggattcgaacctctgaccctctgat > 1:165867‑M2/1‑81 (MQ=255) aaaTAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagccatagaggattcgaacctctgaccctctgat > 1:410757‑M2/1‑81 (MQ=255) aaaTAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagccatagaggattcgaacctctgaccctctgat > 1:1833529‑M2/1‑81 (MQ=255) aatGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagccatagaggattcgaacctctgaccctctgattaaa > 1:3369070‑M2/1‑77 (MQ=255) atGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCattattttgctaaatataaaaattaaatcgtaatgagccatagaggattcgaacctctgaccctctgattaaaa > 1:1194300‑M2/1‑76 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |