| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_16 | = 244 | 97 (0.640) | 91 (0.900) +TTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAAT |
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| ? | Xen36_34 | = 443 | 0 (0.000) | noncoding (1/75 nt) | Xen36_02623 | tRNA‑Gly(gcc) | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GCTCAATTGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGGTTGGGGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCAT‑G‑GAAGAGCCATTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_16/100‑244‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGAGAGATCACCGTACCGGT < Xen36_34/443‑295 ||||||||||||||||||||||||||||||||| GCTCAATTGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGGTTGGGGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCATCT‑TTTGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTAC < 1:1698260/150‑1 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GGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCATCT‑TTTGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTT < 1:698265/150‑1 GGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCATCT‑TTTGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTT > 1:2738573/1‑150 GGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCATCT‑TTTGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTC > 1:938282/1‑150 GTTCCAGTCCTCTGGCCGGCACCATCT‑TTTGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTCGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCA > 1:1508095/1‑150 GTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCATCT‑TTTGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCA > 1:2130836/1‑150 GTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCATCT‑TTTGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGATTCGAATCCTCTATGGCTCATCACGATTTAATCTTTATATTTAGCAAAATACTGCAGAAGTAGTTCA 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caccatcttttGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTG > 1:3260138/12‑150 catcttttGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCA > 1:18604/9‑150 catcttttGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAAACTTGCCA > 1:568116/9‑150 tcttttGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAG < 1:5423/144‑1 tcttttGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACGTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAG < 1:5425/144‑1 cttttGAGCCATTAGCTCAGCTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGG > 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aaGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCG < 1:3664503/148‑1 AGGTTCGAATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCG < 1:676882/150‑1 ATCCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGC < 1:3611096/150‑1 CCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGCAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAG > 1:2827377/1‑150 CCTCTATGGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGCAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAG > 1:886750/1‑150 GGCTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACTCACA > 1:833022/1‑150 CTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGG > 1:2682479/1‑150 CTCATTACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGG > 1:379128/1‑150 TACGATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTA < 1:2173778/150‑1 ATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCCTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAAT < 1:866611/150‑1 ATTTAATTTTTATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCCTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAAT < 1:2822178/150‑1 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1:2301495/150‑1 ATATTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGAG < 1:2301493/150‑1 TTTAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCGGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGAGAGA > 1:1218832/1‑150 TAGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGAG > 1:1985178/1‑145 AGCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGAGAGATCA < 1:2161395/150‑1 GCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGAGAGATCAC > 1:1163720/1‑150 GCAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGAGAGATCAC > 1:1882401/1‑150 CAAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGAGAGATCACC > 1:929517/1‑150 AAAATAATGCAGAAGTGGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGAGAGATCACCG > 1:828078/1‑150 AAAATAATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGAGAGATCACCG > 1:2051139/1‑150 ATGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGAGAGATCACCGTACCGG < 1:3346907/150‑1 TGCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAATCCTGTGGTGAGAGATCACCGTACCGGT > 1:2164794/1‑150 ||||||||||||||||||||||||||||||||| GCTCAATTGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGGTTGGGGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCAT‑G‑GAAGAGCCATTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_16/100‑244‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCAGAAGTAGTTCAGCGGTAGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCATTATTTTGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGAGAGATCACCGTACCGGT < Xen36_34/443‑295 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |