| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_12 | 1 = | 0 (0.000) | 164 (1.120) | 61/226 | 1.2 | 100% | intergenic (–/+620) | –/gabR | –/HTH‑type transcriptional regulatory protein GabR |
| ? | Xen36_15 | 37 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+596) | –/lysS | –/Lysine‑‑tRNA ligase | |||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAATTTTACACTTTGTTGTGAACTTTGTCACATCAGCTTTTAGTGTGTTTCGTCTGTTT > Xen36_15/1‑186 | ccatttttctttgtgttttcttttttactttgacattttagacatacaaaaagagaccctgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggc > 1:3590410‑M2/150‑150 (MQ=255)agccatttttctttgtgttaatttttactttgacattttagacgtaaaaaaagagaccttgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggc < 1:2489473‑M2/1‑1 (MQ=255) ttctttgtgttttcttttttattttgacattttagacataaaaaaagagaccttgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATGGGa < 1:1956404‑M2/7‑1 (MQ=255) tctttgtgttttcttttttactttgacattttagacataaaaaaagagaccttgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATGGGaa > 1:1136019‑M2/143‑150 (MQ=255) ctttgtgttttcttttttactttgacattttagacataaaaaaagagaccttgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATGGGAAc < 1:11852‑M2/9‑1 (MQ=255) gttttcttttttactttgacattttagacataaaaaaagagaccttgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATGGGAACAGgtgt > 1:2645973‑M2/136‑150 (MQ=255) gtgttaatttttactttgacattttagacgtaaaaaaagagaccttgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATggg < 1:1057615‑M2/6‑1 (MQ=255) gtgttaatttttactttgacattttagacgtaaaaaaagagaccttgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATggg < 1:2338952‑M2/6‑1 (MQ=255) 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aaaaaaagagaccttgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACcagacatatga > 1:3566510‑M2/105‑145 (MQ=255) aaaaaagagaccttgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCAccagacatatgaa > 1:2946829‑M2/104‑144 (MQ=255) aaaaagagaccttgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCaccagacatatgaat < 1:978492‑M2/48‑8 (MQ=255) aaaagagaccttgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTcaccagacatatgaatg < 1:3431948‑M2/49‑9 (MQ=255) aaaagagaccttgcggtctcaacttgcctggcaacgttctactctagcggaacgtaagttcgactaccatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTcaccagacatatgaatg < 1:480254‑M2/49‑9 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |