| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Xen36_15 | 37 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+596) | –/lysS | –/Lysine‑‑tRNA ligase | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
AGCCATTTTTCTTTGTGTTTTCTTTTTTACTTTGACATTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAACTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen36_12/151‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑accatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAATTTTACACTTTGTTGT > Xen36_15/37‑146 AGCCATTTTTCTTTGTGTT‑‑AATTTTTACTTTGACATTTTAGACTTAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAACTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGC < 1:3400382/150‑1 CATTTTTCTTTGTGTT‑‑AATTTTTA‑TTTGACATTTTAGACGTAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAACTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGG > 1:2714588/1‑150 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TTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTA > 1:2670237/1‑150 TGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAA < 1:1708948/150‑1 TGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAA > 1:3135331/1‑150 CTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGTTATAGTCACCAGACAAAATAACTCACTTATTTATGATACACGCTTAATTA < 1:1396336/150‑1 CTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATCGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTA < 1:3202996/150‑1 TACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAAT > 1:585892/1‑150 TCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGT > 1:1103769/1‑150 CTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTT > 1:1284707/1‑150 GCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAAT > 1:485354/1‑150 TAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTATGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACGCGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAATTTTACACT > 1:1728100/1‑150 AGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAATTTTACACTTT > 1:3263319/1‑150 GTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAATTTTACACTTTG > 1:713508/1‑150 GTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAATTTTACACTTTG < 1:1503619/150‑1 TTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAATTTTACACTTTGT > 1:220416/1‑150 TTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAATTTTACACTTTGT > 1:1530097/1‑150 TTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAATTTTACACTTTGT < 1:3296513/150‑1 cgaaTACCATAGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACGAAATAACTTACTTATTCGTGATACACGCTTAATTCATAAGGCGAAATAGTTAATTTCACACTTTGTTG > 1:3611932/5‑150 CGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAATTTTACACTTTGTTG < 1:3291365/150‑1 GACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAATTTTACACTTTGTTGT < 1:1965353/150‑1 AGCCATTTTTCTTTGTGTTTTCTTTTTTACTTTGACATTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAACTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen36_12/151‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑accatcgacgctaaggagcttaacttctgtgttcggCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACAAAATAACTTACTTATTTATGATACACGCTTAATTAATAAGGCGCAATAGTTAATTTTACACTTTGTTGT > Xen36_15/37‑146 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |