| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_1 | 648761 = | 91 (0.600) | 64 (0.500) +C |
34/296 | 2.9 | 58.6% | intergenic (+687/–) | Xen36_00617/– | hypothetical protein/– |
| ? | Xen36_33 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+70) | –/Xen36_02617 | –/hypothetical protein | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAAATCCATTA > Xen36_33/1‑150 | tatttttgcaacatatttatattcgccatcttcgcctaaatctttaagataagctatcttttgtgattctgcTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCtatttat < 1:3718420‑M2/78‑1 (MQ=255) atttttgcaacatatttatattcgccatcttcgcctaaatctttaagataagctatcttttgtgattctgcTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCtatttatt < 1:3135170‑M2/79‑1 (MQ=255) atttttgcaacatatttatattcgccatcttcgcctaaatctttaagataagctatcttttgtgattctgcTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCtatttatt < 1:2116126‑M2/79‑1 (MQ=255) ttttgcaacatatttatattcgccatcttcgcctaaatctttaagataagctatcttttgtgattctgcTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTattaa < 1:1893043‑M2/81‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |