New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	Xen36_1	648761 =	91 (0.600)	64 (0.500) +C	34/296	2.9	58.6%	intergenic (+687/–)	Xen36_00617/–	hypothetical protein/–
	?	Xen36_33	1 =	0 (0.000)					intergenic (–/+70)	–/Xen36_02617	–/hypothetical protein

TATTTTTGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  Xen36_1/648831‑648761 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAAATCCA  >  Xen36_33/1‑147                                                                        |                                                                                                                                                    TATTTTTGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTAT                                                                       <  1:3718420/150‑1  ATTTTTGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATT                                                                      <  1:3135170/150‑1  ATTTTTGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATT                                                                      <  1:2116126/150‑1    TTTTGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAA                                                                    <  1:348372/150‑1    TTTTGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAA                                                                    <  1:1893043/150‑1    TTTTGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAA                                                                    <  1:872309/150‑1    TTTTGCAACACATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAGAAGCAGATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTACTTATTAA                                                                    <  1:2031118/150‑1     TTTGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAAT                                                                   <  1:47724/150‑1          AACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAACTCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTACATAGTTACAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTCCTATATTTTCGTGTAGAACGGATGCTATTTATTAATTATTT                                                              >  1:603324/1‑150          AACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTT                                                              >  1:3540856/1‑150          AACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTCGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTT                                                              >  1:603320/1‑150           ACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTGTCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTG                                                             >  1:1648310/1‑150           ACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTGTCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTG                                                             >  1:3113968/1‑150             ATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTA                                                           <  1:2170797/150‑1             ATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTA                                                           <  1:3151830/150‑1             ATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTA                                                           <  1:3151829/150‑1                  TATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTACAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCT                                                      >  1:1063141/1‑150                  TATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCT                                                      >  1:2528217/1‑150                  TATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCT                                                      >  1:1063138/1‑150                    TATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAGGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTT                                                    <  1:1380127/150‑1                    TATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAATGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTT                                                    >  1:2288182/1‑150                      TTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATATATTAATTATTTGTATGTCTTTAA                                                  <  1:2355740/150‑1                       TCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAAT                                                 <  1:1726480/150‑1                        CGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATT                                                >  1:1124906/1‑150                          CCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTC                                              <  1:3538618/150‑1                           CATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCA                                             <  1:2471042/150‑1                            ATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAG                                            <  1:2494739/150‑1                            ATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAG                                            <  1:1265074/150‑1                              ccTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAG                                          <  1:91302/148‑1                              CTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAG                                          <  1:1976294/150‑1                              CTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAG                                          <  1:3109150/150‑1                               TTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGT                                         >  1:2751226/1‑150                               TTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGT                                         >  1:2751227/1‑150                               TTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGT                                         >  1:606649/1‑150                                 CGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCA                                       >  1:38779/1‑150                                 CGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCA                                       >  1:268590/1‑150                                 CGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCA                                       >  1:2578792/1‑150                                   CCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATC                                     >  1:1592753/1‑150                                        ATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAG                                <  1:1690668/150‑1                                          CTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAA                              >  1:2698691/1‑150                                          CTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAA                              >  1:423058/1‑150                                           TTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAAT                             <  1:520563/150‑1                                             TAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATAT                           >  1:358837/1‑150                                                GATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATA                        <  1:2554829/150‑1                                                GATAAGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATA                        <  1:2554828/150‑1                                                    AGCTATCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCATCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCA                    >  1:1856370/1‑150                                                         TCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTGAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAG               >  1:3512976/1‑150                                                         TCTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTGAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAG               >  1:3344306/1‑150                                                          CTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCGCTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGG              <  1:744190/150‑1                                                          CTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGG              <  1:3188166/150‑1                                                          CTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAACATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGG              <  1:3702169/150‑1                                                             TTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTAT           >  1:1629118/1‑150                                                              TGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATC          <  1:1258558/150‑1                                                              TGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATC          <  1:2933572/150‑1                                                                 GATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAA       >  1:1593484/1‑150                                                                 GATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAA       >  1:1800342/1‑150                                                                    gCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAAATC    <  1:658746/149‑1                                                                    TCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAAATC    <  1:2761846/150‑1                                                                    TCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAAATC    <  1:658744/150‑1                                                                    TCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAAATC    <  1:1440928/150‑1                                                                     CTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAAATCC   >  1:2789325/1‑150                                                                     CTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAAATCC   >  1:2789326/1‑150                                                                     CTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAAATCC   >  1:749220/1‑150                                                                      TGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAAATCCA  >  1:269818/1‑150                                                                        |                                                                                                                                                    TATTTTTGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCGCCTAAATCTTTAAGATAAGCTATCTTTTGTGATTCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  Xen36_1/648831‑648761 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGCATATAAAAATAGCACCACTTTCTATATTTTTGTGTAGAAAGGATGCTATTTATTAATTATTTGTATGTCTTTAATTTCAGAGTCATCTATAGAATATATACCCATTGAGGTATCTAAATCCA  >  Xen36_33/1‑147

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.