| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_1 | = 162609 | 118 (0.780) | 100 (0.760) +TGTAAGCTGACTTTCCGC |
52/262 | 1.5 | 49.1% | intergenic (+378/‑450) | trxB/Xen36_00155 | Thioredoxin reductase/Nucleotide‑binding protein |
| ? | Xen36_1 | 169199 = | 118 (0.780) | intergenic (+216/+230) | mleS/Xen36_00161 | Malolactic enzyme/Epimerase family protein | |||||
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
AATTAATCAACCAATATTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCAATAT > Xen36_1/169050‑169348 | ccgccaacttgcacattattgtaagctgactttccgccagcttctatgttggggccccgccaacttgcacattattgtaagctgactttccgtcagcttctatgttggggccccgCCAACTTGCACATTATTGTAGGCTGACTTTCCGTc < 1:657230‑M1/35‑1 (MQ=255)aaTTAATCAACCAATATTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTc < 1:3216957/150‑1 (MQ=255) aTTAATCAACCAATATTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGCTGTCCCACCCCAACTTGCAAATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCa > 1:429651/1‑150 (MQ=255) ttacatattagccacagctaatgtgtanttaaaaataggaatacatgagtaaaacgcatgcataagaaatactaatttctatagaaaaagtatttcgttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAg < 1:2551188‑M2/3‑1 (MQ=255) aTCAACCAATATTCATAAGTGNCTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCtt > 1:3477538/1‑150 (MQ=255) aTCAACCAATATTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCtt > 1:1335962/1‑150 (MQ=255) cattagccacagctaatgtgtactaaaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTc > 1:1317610‑M2/144‑150 (MQ=255) acttgcacattattgtaagctgactttccgccagtttctatgttggggccccgccaacttgcacattattgtaagctgactttccgtcagcttctatgttggggccccgCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTc > 1:1241678‑M1/110‑150 (MQ=255) cttgcgcattattntaagctgactttccgccggcttctatgttggggccccgccaacttgcacatgattgtaagctgactttccgtcagcttctatgttggggccccgCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCt < 1:3560454‑M1/42‑1 (MQ=255) cattagccacagctaatgtgtacttaaaaataggaatacatgagtaaaacgcatgcataagaaatactaatttctatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacctgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCt < 1:3125277‑M2/8‑1 (MQ=255) cAACCAATATTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTT‑GTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTa < 1:1410828/150‑1 (MQ=255) attagccacagctaatgtgtactaaaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCt > 1:1179613‑M2/143‑150 (MQ=255) ttgcacattattgtaagctgactttccgccagcttctatgttggggccccgccaacttgcacattattgtaagctgactttccgtcagcttctatgttggggccccgCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTa > 1:277941‑M1/108‑150 (MQ=255) atatTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTg < 1:2886066/150‑1 (MQ=255) attattgtaagctgactttccgccagcttctatgttggggccccgccaacttgcacattattgtaagctgactttccgtcagcttctatgttggggccccgCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTgg < 1:1882663‑M1/49‑1 (MQ=255) ttattgtaagcctactttccgccagcttctatgttggggccccgccaacttgcacattattgtaagctgacgttccgtcagcttctatgttggggccccgCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTggg > 1:3446291‑M1/101‑150 (MQ=255) atTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTggg < 1:3032050/150‑1 (MQ=255) atTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATACGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGAACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTggg < 1:701511/150‑1 (MQ=255) tCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGc < 1:3392606/150‑1 (MQ=255) ttgtaagctgactttccgccagcttctatgttggggccccgccaacttgcacattattgtaagctgactttccgtcagcttctatgttggggccccgCCAACTCGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGcc < 1:779566‑M1/53‑1 (MQ=255) aaGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAATCGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCg < 1:2553603/150‑1 (MQ=255) actaaaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACt < 1:1577184‑M2/28‑1 (MQ=255) taaaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTg > 1:1340694‑M2/121‑150 (MQ=255) taaaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTg > 1:2954112‑M2/121‑150 (MQ=255) taaaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTg > 1:2954110‑M2/121‑150 (MQ=255) ctttccgccagcttctatgttggggccccgccaacttgcacattattgtaagctgactttccgtcagcttctatgttggggccccgCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTg > 1:833888‑M1/87‑150 (MQ=255) cttaaaaataggaatacatgagtaaaacgcatgcataagaaatactaatttctatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTg > 1:1475110‑M2/121‑150 (MQ=255) ttaaaaataggaatacatgagcaaaacgcatgcataagaaatactaatttctatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactctccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGc < 1:29272‑M2/31‑1 (MQ=255) tAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGc < 1:748711/150‑1 (MQ=255) tAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGc < 1:748708/150‑1 (MQ=255) taaaaataggaatacatgagtaaaacgcatgcataagaaatactaatttctatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGca > 1:3542445‑M2/119‑150 (MQ=255) aaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGca < 1:3594976‑M2/32‑1 (MQ=255) aaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGca > 1:3727953‑M2/119‑150 (MQ=255) aaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGca > 1:1899867‑M2/119‑150 (MQ=255) aaaataggaatacatgagtaaaacgcatgcataagaaatactaatttctatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTtgcaaa > 1:3683621‑M2/117‑148 (MQ=255) aaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACttgcattg > 1:561116‑M2/116‑147 (MQ=255) gccagcttctatgttggggccccgccaacttgcacattattgtaagctgactttccgtcagcttctatgttggggccccgCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAActtgcattgt < 1:232040‑M1/70‑5 (MQ=255) atatCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACattat < 1:2036701/150‑1 (MQ=255) tatCTATATGTAATATCAGCCAATAGAAGGGAGTGGTACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGCCTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCGCattatt > 1:940806/1‑150 (MQ=37) tatCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGTACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTCGCACattatt > 1:682466/1‑150 (MQ=255) ggaatacatgagtaaaacgcatgcataagaaatactaatttctatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTg < 1:2253223‑M2/40‑1 (MQ=255) ctcgctatGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTg < 1:1347550/145‑1 (MQ=255) tCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTCTTTTGTTGTCCCACACCAACTTGCATATTATTGTAGGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGACCCCGCCAACTTGCACATCATTGt > 1:7224/1‑150 (MQ=38) 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tgttgcCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGaaaa > 1:180690/1‑150 (MQ=255) gttgtCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcacattattgtaagctgac > 1:2678912‑M2/1‑125 (MQ=255) gtCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTCAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCTGGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTAAAAAAAGc > 1:3534487/1‑150 (MQ=18) gtCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTagag < 1:1307876/139‑1 (MQ=255) cccACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCtt > 1:3130499/1‑150 (MQ=255) cccccccaacTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtccgtagaaattgggaatcc < 1:3616139‑M1/147‑32 (MQ=255) cccAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGc > 1:1974849/1‑150 (MQ=255) cAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctgtagaaattgggaatccaatttc < 1:106606‑M1/150‑38 (MQ=255) cAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctgtagaaattgggaatccaatttc > 1:2069114‑M1/1‑113 (MQ=255) aCTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctgtagaaattgggaatccaatttctc < 1:615298‑M1/150‑40 (MQ=255) cTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctgtagaaattgggaatccaatttctct > 1:1622122‑M1/1‑110 (MQ=255) cTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAgcg < 1:2148071/150‑1 (MQ=255) cTTGCACATTATTGTAAGCTGACCTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAgcg < 1:3367546/150‑1 (MQ=255) aaGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAgcg < 1:762230/135‑1 (MQ=255) gCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctgtagaaattgggaatccaatttctctttgttggggcccacacc > 1:671091‑M1/1‑93 (MQ=255) cTTTCCGTCAGCTTCTCTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTCTTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGAGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAAAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAactact > 1:1453518/1‑150 (MQ=37) tCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGcc < 1:2730300/150‑1 (MQ=255) tCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGcc > 1:153612/1‑150 (MQ=255) cGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCaa > 1:26337/1‑150 (MQ=255) ggcAGCTTTTGTGTTGGGGCCACACCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCaat < 1:1922803/148‑1 (MQ=25) gTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctgtagaaattgggaatccaatttctctttgttggggcccacaccccaactcgcat > 1:226486‑M1/1‑82 (MQ=255) gTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCaat > 1:2133154/1‑150 (MQ=255) | AATTAATCAACCAATATTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCAATAT > Xen36_1/169050‑169348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |