| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_1 | = 162609 | 118 (0.780) | 100 (0.760) +TGTAAGCTGACTTTCCGC |
52/262 | 1.5 | 49.1% | intergenic (+378/‑450) | trxB/Xen36_00155 | Thioredoxin reductase/Nucleotide‑binding protein |
| ? | Xen36_1 | 169199 = | 118 (0.780) | intergenic (+216/+230) | mleS/Xen36_00161 | Malolactic enzyme/Epimerase family protein | |||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
ATTTATTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_1/162461‑162609‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGT > Xen36_1/169199‑169286 |||||||||||||||||| ATTTATTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATT > 1:3504672/1‑150 tgTTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGATGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTA < 1:3380412/148‑1 TATTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTA < 1:73118/150‑1 TATTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTA < 1:3371088/150‑1 TATTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTA < 1:2040982/150‑1 ATTATGTAGTGGTTCTTACACATTGGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAG < 1:1025685/150‑1 ATTATGTAGTGGTTCTTACACATTGGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAG < 1:2870271/150‑1 ATTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAG < 1:1914494/150‑1 TTATGTAGTGGTTCTTATACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGC < 1:66187/150‑1 TTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGC < 1:668140/150‑1 TTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGC < 1:1215330/150‑1 TTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTCCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGC < 1:1215327/150‑1 TTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAG > 1:364771/1‑150 TATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCT > 1:629842/1‑150 TATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGC < 1:1540522/150‑1 TGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGA < 1:732962/150‑1 TGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTG > 1:1312164/1‑150 TGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTG < 1:2464190/150‑1 GTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGcc > 1:1849149/1‑148 GTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGAC < 1:1659429/150‑1 GTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGA < 1:845440/150‑1 GTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGA < 1:2819111/150‑1 TGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTC < 1:1833254/150‑1 GGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCC > 1:2110277/1‑150 GGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACCTTCC > 1:2110276/1‑150 GTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCG < 1:1663235/150‑1 ttccTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAACTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACGTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGC < 1:2012520/146‑1 TTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGC < 1:2012521/150‑1 TTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATCTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGC > 1:1760676/1‑150 TTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATCTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGC > 1:1394603/1‑150 TTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATCTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGC > 1:1394602/1‑150 TTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCA > 1:1869412/1‑150 TTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCA > 1:1869415/1‑150 TACACATTAGTCACAGCTAATGTGTACTTAAAAA‑TAGGAATACATGAGTAAAACGCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGC < 1:1635214/150‑1 TACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTACTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAG < 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1:521878/150‑1 ATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGG < 1:21385/150‑1 ACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGG > 1:64862/1‑150 TTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGC < 1:1002572/150‑1 ATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaac < 1:3480733/150‑4 AGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCATCTTATATGTTGGGGCCCCGCCaacgt > 1:3769080/1‑145 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ATTTATTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTAAAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_1/162461‑162609‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGT > Xen36_1/169199‑169286 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |