| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_1 | 1 = | 0 (0.000) | 158 (1.050) | 72/270 | 0.5 | 100% | intergenic (–/‑105) | –/nth_1 | –/Endonuclease III |
| ? | Xen36_14 | = 47747 | 0 (0.000) | intergenic (+232/–) | argS/– | Arginine‑‑tRNA ligase/– | |||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
GGGGAATGCTTAGTATGTGAATAAGGTTAAAGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_14/47598‑47761 | ggggAATGCTTAGTATGTGAATAAGGTTAAAGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCCAATc > 1:3344618/1‑150 (MQ=255) gggAATGCTTAGTATATGAATAAGGCTAAAGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCg > 1:1691746/1‑150 (MQ=255) gattttGCTTAGGATGTGAATAAGGGTAAAGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGTGGAGTTAA‑A‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCg < 1:774589/145‑1 (MQ=37) gCTTAGTATGTGAATAAGGTTAAAGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAg < 1:1113879/150‑1 (MQ=255) cTTAGTATGTGAATAAGGTTAAAGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGc > 1:2500433/1‑150 (MQ=255) cTTAGTATGTGAATAAGGTTAAAGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGc < 1:238287/150‑1 (MQ=255) ctcaaggggagTTAAGGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAACCCAAGGGG‑GTTAA‑AAGAATACAGTTAGCTTGCTTGCGTAGCACCTGCAAAAGAGCCCATACCCGCTaaattt > 1:1431800/11‑141 (MQ=2) ctcaaggggagTTAAGGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTCCAAAAGAGCCCCCAATCGCTAAAGCTCAAGGGGTTTAAA‑G‑GAATACAGTCGGCTTGCTTGCGCAACAACTGCAAAAGAATCCCTAATCACTAAAGCTCGAgga > 1:3242060/11‑149 (MQ=9) tcaaggggagTTAAAGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGAGTGAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTACTCGCt > 1:1293777/10‑137 (MQ=21) gtgAATAAGGTTAAAGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTGATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACATTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaagggg > 1:3734210‑M2/1‑134 (MQ=255) ggggagttaaaGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑A‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAACAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagtt < 1:483421‑M2/145‑21 (MQ=255) aGGTTAAAGAATACAGTTTGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTGAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAggggagttaaag < 1:2013531/150‑11 (MQ=21) agTTAAGGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAggggagttaagg > 1:593936/2‑140 (MQ=21) agTTAAAGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAATTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAgggggttaaagg < 1:409055/149‑11 (MQ=21) gTTAAGGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑A‑GAATACAGTTGGCCTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAggggagttaaagaa > 1:1605777/1‑138 (MQ=18) gTTAAGGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCGCTAAAGCTCAAggggagttaaggaa > 1:1694219/1‑138 (MQ=18) gTTAAAGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTCGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaagga > 1:6199‑M2/1‑125 (MQ=255) aaGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGTAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatac > 1:2069040‑M2/1‑121 (MQ=255) aaTACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGTTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagt > 1:1123172‑M2/1‑118 (MQ=255) gtACATTTGGTTTGTTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑A‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAggggg < 1:588881/132‑4 (MQ=18) tACAGTTTGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttg > 1:1646390‑M2/1‑116 (MQ=255) tACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGTTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttg > 1:467224‑M2/1‑116 (MQ=255) tACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGGGTAAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttg > 1:1646388‑M2/1‑116 (MQ=255) cAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑A‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggc > 1:712226‑M2/1‑114 (MQ=255) cAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggc < 1:2325804‑M2/150‑37 (MQ=255) tGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaagggggttcaaggaatacagttggcttgc < 1:1164200‑M2/150‑41 (MQ=255) ctcttgcttgcgCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaagggggttaaaggaatacagttggcttgct > 1:393811‑M2/3‑109 (MQ=255) gcttgcttGCGCAGCGACTGCGAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgctt < 1:2148089‑M2/150‑43 (MQ=255) gcttgcttGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgctt > 1:1682568‑M2/1‑108 (MQ=255) cttgcttgCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttg > 1:1136513‑M2/1‑107 (MQ=255) cttgcttgCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAACCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttg < 1:220137‑M2/150‑44 (MQ=255) ttgcttgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaagggggttaaaggaatacagttggcttgcttgc > 1:248273‑M2/1‑106 (MQ=255) gtttgtgcAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑A‑GAATGCAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggggtgaaggaatacagttggcttgcttgcgc > 1:971016‑M2/3‑104 (MQ=255) gcttgcGCAGTAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAGAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgc > 1:1311072‑M2/1‑104 (MQ=255) gcttgcGCAGCAACTGCAAAATAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgc > 1:1032548‑M2/1‑104 (MQ=255) gcttgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgc > 1:1032551‑M2/1‑104 (MQ=255) gcttgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgc > 1:415057‑M2/1‑104 (MQ=255) gcttgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcgagggggttaaaggaatacagttggcttgcttgcgc > 1:1232878‑M2/1‑104 (MQ=255) gcttgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaagggggttaaaggaatacagttggcttgcttgcgc > 1:1925196‑M2/1‑104 (MQ=255) gcttgcGCAGCAACTACAAAAGAGCCCCTAACCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgc > 1:1616822‑M2/1‑104 (MQ=255) cttgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAGGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgca < 1:1499686‑M2/150‑48 (MQ=255) cttgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGGTAA‑A‑GAATCCAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttg > 1:1708782‑M2/1‑103 (MQ=255) ttgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑A‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcag > 1:1793267‑M2/1‑102 (MQ=255) ttgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcac > 1:178311‑M2/1‑102 (MQ=255) tgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcaca < 1:2106330‑M2/150‑50 (MQ=255) tgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttg > 1:3648644‑M2/1‑101 (MQ=255) gcgcAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTGAA‑A‑GAATACGGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcagca > 1:3276027‑M2/1‑100 (MQ=255) cgcAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagctaaggaatacagttggcttgcttgtgcacaac < 1:1887436‑M2/150‑52 (MQ=255) cgcAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑A‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcac < 1:1618020‑M2/150‑52 (MQ=255) gcagcaACTGCAAAAGGGCCACTAATCGTTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTTGCTTGTTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggg > 1:719617‑M2/1‑98 (MQ=255) gcagcaACGGAAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGGTCAAGGGGAGTTAA‑A‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgctt > 1:791889‑M2/1‑98 (MQ=255) gcaACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcag > 1:387259‑M2/1‑95 (MQ=255) gactgcaacatcgccccgaatcgctAAAGCTCAAGGGGGGTAAA‑G‑GGATACAGTTGGCTTGTTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaa > 1:2397920‑M2/13‑93 (MQ=255) aCTGCAAAAGAGCCCCGAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑A‑GAATACGGTTGGCTTGCGGGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgattgcgcagcaactgcaaa > 1:2299373‑M2/1‑92 (MQ=255) cTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGACCCTCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaag < 1:420604‑M2/150‑60 (MQ=255) cTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcaaaactgtagaag < 1:3622716‑M2/150‑60 (MQ=255) tGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaaga < 1:1398758‑M2/150‑61 (MQ=255) gCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgc < 1:2033488‑M2/135‑47 (MQ=255) cAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggagagttaaggaatccagttggcttg < 1:3579884‑M2/127‑40 (MQ=255) cAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCGACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagc < 1:1563319‑M2/150‑63 (MQ=255) cAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttcaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagc < 1:944115‑M2/150‑63 (MQ=255) cAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagc < 1:2839678‑M2/150‑63 (MQ=255) aaaGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgtgcacaactgcaaaagagccc > 1:3332203‑M2/1‑86 (MQ=255) cccTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCACAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccc > 1:3594069‑M2/1‑79 (MQ=255) cccTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagtgaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcg > 1:2239232‑M2/1‑79 (MQ=255) tAATCGCTAAAGTTCGAGGGGATTTAA‑A‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgc > 1:1963108‑M2/1‑76 (MQ=255) tAATCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgcta < 1:3038071‑M2/150‑75 (MQ=255) aaTCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcagaactgcaaaagagcccaccaccagcaa < 1:2563277‑M2/150‑76 (MQ=255) aTCGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaa < 1:3159129‑M2/150‑77 (MQ=255) cGCTAAAGCTCAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaaac > 1:3311575‑M2/1‑72 (MQ=255) gCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑A‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatac > 1:3209756‑M2/1‑71 (MQ=255) tAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagttca > 1:88777‑M2/1‑69 (MQ=255) gctcaAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggg < 1:1916393‑M2/148‑86 (MQ=255) gTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagttcaaggg < 1:3551072‑M2/150‑86 (MQ=255) tttaagtgGAGTTAA‑A‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCACTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttg > 1:1986597‑M2/4‑64 (MQ=255) ctcAAGGGG‑GTTAAAG‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaagggg < 1:3544349‑M2/149‑87 (MQ=255) ggggAGTTAG‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaag < 1:351471‑M2/118‑60 (MQ=255) gggttaaa‑g‑gaataCAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaa < 1:177878‑M2/144‑94 (MQ=255) ggAGTAAA‑G‑GAATACAGTTTGCTTGCTTGCCCAGCAACTGTAAAAGAGCCCCTAATCtctgaagctcagggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagcttaaggggctctaaa > 1:3608643‑M2/1‑57 (MQ=255) gAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAACAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaagggggttaaaggaatacagttggcttgcttgcgca > 1:824400‑M2/1‑56 (MQ=255) ttgaa‑g‑gaCTGCAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACGGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaagg > 1:1749848‑M2/4‑54 (MQ=255) taaa‑g‑gAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaagga < 1:512192‑M2/148‑98 (MQ=255) aaa‑g‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggag > 1:482184‑M2/2‑52 (MQ=255) aaa‑g‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggag > 1:3052158‑M2/2‑52 (MQ=255) a‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTGGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgcgaaagctcaaggggagttaggggatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggagga > 1:1023363‑M2/1‑50 (MQ=255) a‑G‑GAAGACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACGGCAAAAGAGCCCCTAATCgcgaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggagga > 1:1023365‑M2/1‑50 (MQ=255) gAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggaggatg > 1:735854‑M2/1‑48 (MQ=255) cAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcc < 1:776116‑M2/106‑64 (MQ=255) gTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTCCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggaggatgtaaatgt > 1:3720122‑M2/1‑41 (MQ=255) cttgcttgCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggaggatgtaaatgttagga < 1:3472946‑M2/150‑115 (MQ=255) ttgcttgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggaggatataaatgttaggaa < 1:1579692‑M2/150‑116 (MQ=255) cttgcGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggaggatgtaaatgttaggaactg < 1:108523‑M2/150‑119 (MQ=255) cgcAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggaggatgtaaatgttaggaactgatga < 1:2118623‑M2/150‑123 (MQ=255) agcaACTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggaggatgtaaatgttaggaactgatgaatt < 1:858575‑M2/150‑126 (MQ=255) aaCTGCAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggaggatgtaaatgttaggaactgatgaattgta < 1:679745‑M2/150‑129 (MQ=255) cAAAAGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggaggatgtaaatgttaggaactgatgaattgtacaaat < 1:1404963‑M2/150‑134 (MQ=255) aaaaGAGCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgctggcacacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggaggatgtaaatgttaggaactgatgaattgtataaatt > 1:1939633‑M2/1‑16 (MQ=255) gCCCCTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggaggatgtaaatgttaggaactgatgaattgtataaattgttata < 1:2172593‑M2/150‑141 (MQ=255) cccTAATCgctaaagctcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaaggaggatgtaaatgttaggaactgatgaattgtataaattgtt > 1:1258461‑M2/1‑8 (MQ=255) cccGAATCgctaaagctcaggtggggttagggaatacggttggcttgttggcgcacaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaaggggctctaaaagtaggatgtaaatgttaggaactgatgaattgtataaattgtt > 1:3658847‑M2/1‑8 (MQ=255) | GGGGAATGCTTAGTATGTGAATAAGGTTAAAGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGTTCAAGGGGAGTTAA‑G‑GAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAGCAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_14/47598‑47761 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |