| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_1 | 1 = | 0 (0.000) | 158 (1.050) | 72/270 | 0.5 | 100% | intergenic (–/‑105) | –/nth_1 | –/Endonuclease III |
| ? | Xen36_14 | = 47747 | 0 (0.000) | intergenic (+232/–) | argS/– | Arginine‑‑tRNA ligase/– | |||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATA > Xen36_1/1‑140 | gtgaataaggttaaagaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctgatcgctaaagttcaaggggagttaaggaatacatttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAgggg > 1:3734210‑M1/135‑150 (MQ=255) ggggagttaaagaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagttcaaggggagttaaagaatacagttggcttgcttgcgcaacaactgcaaaagagccactaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGtt < 1:483421‑M1/20‑1 (MQ=255) ggttaaagaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagttcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑gg > 1:1117536‑M1/127‑150 (MQ=255) gttaaagaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagttcaaggggagttaaggaatacagtcggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGa > 1:6199‑M1/126‑150 (MQ=255) taaagaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagttcaaggggagttaaagaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagccactaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGAAt < 1:2494339‑M1/27‑1 (MQ=255) aagaatacagttggcttgcttgcgcagtaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagttcaaggggagttaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGAATAc > 1:2069040‑M1/122‑150 (MQ=255) gaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaagggggttaaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGAATACAg > 1:1495454‑M1/120‑150 (MQ=255) gaatacagtcggcttgcttacgcagcaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagctcaagggggttaaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGAATACAg > 1:3313549‑M1/120‑150 (MQ=255) aatacagttggcttgtttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcgctaaagttcaaggggagttaaggaatacagttggcttgtttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGAATACAGt > 1:1123177‑M1/119‑150 (MQ=255) 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1:1749848‑M1/55‑150 (MQ=255) taaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAagga < 1:456816‑M1/97‑1 (MQ=255) taaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAagga < 1:512192‑M1/97‑1 (MQ=255) aaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAaggag > 1:482184‑M1/53‑150 (MQ=255) aaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAaggag > 1:1696136‑M1/53‑150 (MQ=255) aaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAaggag > 1:3052158‑M1/53‑150 (MQ=255) 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTAAAGCTCAAGGGGAGTT‑AA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATA > Xen36_1/1‑140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |