| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Xen36_13 | = 127 | NA (NA) | intergenic (–/+327) | –/copA | –/Copper‑exporting P‑type ATPase | |||||
TACTTGACCATTTTCAAGGTTAACTTCAGCTGAAGTGACACCGTCAATATTATTTAATGCAGATTCAACAGCACTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCATAGTGTACTTATTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_11/74518‑74743 | tacttGACCATTTTCAAGGTTAACTTCAGCTGAAGTGACACCGTCAATATTATTTAATGCAGATTCAACAGCACTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCa > 1:2227874/1‑150 (MQ=255) cttGACCATTTTCAAGGTTAACTTCAGCTGAAGTGACACCGTCAATATTATTTAATGCAGATTCAACAGCACTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACt < 1:1352824/150‑1 (MQ=255) tGACCATTTTCAAGGTTAACTTCAGCTGAAGTGACACCGTCAATATTATTTAATGTAGATTCAACAACACTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACtta > 1:3476761/1‑150 (MQ=255) ccATTTTCAAGGTTAACTTCAGCTGAAGTGACACCGTCAATATTATTTAATGCAGATTCAACAGCACTTTTGCAGTGACTACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACttatta < 1:285849/150‑1 (MQ=255) 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ccATTTTCAAGGTTAACTTCAGCTGAAGTGACACCGTCAATATTATTTAATGCAGATTCAACAGCACTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACttatta > 1:1387851/1‑150 (MQ=255) cATTTTCAAGGTTAACTTCAGCTGAAGTGACACCGTCAATATTATTTAATGCAGATTCAACAGCACTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTtattat < 1:3410888/150‑1 (MQ=255) cATTTTCAAGGTTAACTTCAGCTGAAGTGACACCGTCAATATTATTTAATGCAGATTCAACAGCACTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTtattat > 1:504924/1‑150 (MQ=255) aTTTTCAAGGTTAACTTCAGCTGAAGTGACACCGTCAATATTATTTAATGCAGATTCAAAAGCACTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGTATTCCCCTCCTTTTAGAGCCACttattctt > 1:3700315/1‑147 (MQ=255) ttttCAAGGTTAACTTCAGCTGAAGTGACACCGTCAATATTATTTAATGCAGATTCAACAGCACTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTAttattt > 1:3736941/1‑150 (MQ=255) 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cACTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCATAGTGTACt < 1:1752863/150‑1 (MQ=255) cACTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCATAGTGTACt < 1:1752865/150‑1 (MQ=255) cTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCATAGTGTACtta > 1:3559159/1‑150 (MQ=255) cTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTAAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCATAGTGTACtta > 1:532988/1‑150 (MQ=255) ttGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCATAGTGTACttatta < 1:364688/150‑1 (MQ=255) gCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCATAGTGTACttattatt > 1:394440/1‑148 (MQ=255) gTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCATAGTGTACttattatttat < 1:304508/150‑6 (MQ=255) gACCACAGTTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCa > 1:2128771/1‑129 (MQ=255) ccACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCATAGTGTACttattatttataata < 1:1978902/150‑10 (MQ=255) acaGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTATGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCTAACTGTAAACCATAGTGTACttattatttataataat < 1:1386470/150‑12 (MQ=21) acaGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTATGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCTAACTGTAAACCATAGTGTACttattatttataataat < 1:2973443/150‑12 (MQ=21) | TACTTGACCATTTTCAAGGTTAACTTCAGCTGAAGTGACACCGTCAATATTATTTAATGCAGATTCAACAGCACTTTTGCAGTGACCACAGCTCATACCTTCAACATTTAAAATTTCTTGTGACATAGCATTCACCTCCTTTTAGAGCCACTTATTATTTATAA‑TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCATAGTGTACTTATTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_11/74518‑74743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |