| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_14 | 47623 = | 135 (0.740) | 69 (0.390) +TCC |
48/292 | 4.5 | 51.1% | intergenic (+108/–) | argS/– | Arginine‑‑tRNA ligase/– |
| ? | Xen36_14 | = 47761 | 0 (0.000) | intergenic (+246/–) | argS/– | Arginine‑‑tRNA ligase/– | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen36_14/47761‑47623‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACC < Xen36_14/47761‑47622 ||| CCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGGTTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAac < 1:3645129/150‑3 GCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTACCTCCCCTTGAACTTTAGC > 1:2010648/1‑150 GCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAAATGTATTCTTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGC > 1:2010646/1‑150 CTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCG < 1:726027/150‑1 TAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATT > 1:1442610/1‑150 TAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATT < 1:1061505/150‑1 AGCGATTGGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTA < 1:838659/150‑1 AGCGAGTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTTCACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGA < 1:1293777/137‑1 GCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAG < 1:3241154/150‑1 CGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGG < 1:1939766/150‑1 CGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGG < 1:1168166/150‑1 GATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTATATTCTTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGG > 1:3393357/1‑150 TTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGC < 1:999133/150‑1 TTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGC < 1:1474810/150‑1 GGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTT < 1:1084077/150‑1 CTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCA < 1:1785824/150‑1 CTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACCGTATTCCTTTAGTCCCCTTGGGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑CTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCA < 1:2128094/150‑1 TTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGT < 1:1413694/150‑1 TGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATCAGGGGCTCTTTTGCAGTTG > 1:2116837/1‑150 TGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACTCCACTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTG < 1:1512975/150‑1 GCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGACTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGC < 1:1633043/150‑1 tTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATGAGGGGCTCTTTGGAAGT‑GTTGCGCAAGCAAGCCAACTGGA‑TT‑C‑TGTAACTTCCCTGGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCG < 1:1361918/149‑1 tgtccTCCTTAAATCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCC < 1:1955672/145‑1 TGTATTCCTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCC < 1:1955675/150‑1 TGTATTCCGTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGAGTAGGGGCTTTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCC < 1:57997/150‑1 TATTCCTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT < 1:2032902/150‑1 CCTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACT < 1:593935/150‑1 CCTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACT < 1:593936/150‑1 cCCCCTTGAATTTCATCGATGAGGGGCTCTTTTCCAGT‑GCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑CTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCA < 1:598162/116‑1 CCCCTTGAGCGTTAGCGATTATTGGCTCTTTTGCAGGTGCTGCGAAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTGAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTT‑AACTCCCCTTGA < 1:1612093/150‑1 CCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAg < 1:2107377/150‑2 CCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAgc < 1:1779565/150‑3 TTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTT > 1:3283139/1‑150 gCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGC < 1:2239358/149‑1 ctgTAGCGAGTGGGGGCTCTTTTGAAGTTGCTGCGCAAGCAAGTCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTCGCGAGTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTT‑AACTCCCCTTGAACTTTAGCG < 1:726026/147‑1 CTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑CTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCAATTCGTGGCTCTCTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAATCCAACTGCATTCTTT‑AACTCCCCTTGAACTTTAGCG > 1:60920/1‑150 AGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑CTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTT‑AACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTA < 1:838660/150‑1 CGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CTCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTGGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGt < 1:1811457/150‑2 CGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGt > 1:1362592/1‑149 GATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑CTTAACTCACCTTGAGCTTCAACGATTAGCGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTT‑AACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGG > 1:654236/1‑150 ATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGtgg < 1:1761088/150‑4 ATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGtgg < 1:3643345/150‑4 AGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGTAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACCCCCCTTGAACTTTcgagattcatggctc > 1:1726601/1‑135 GGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAAATGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTT > 1:2044755/1‑133 tGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAGCTGTATTCTTT‑AACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTT < 1:1084079/149‑1 GGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCACAAGCAAGCTAACTGTACTC‑C‑TTTAAC‑CTCCTGGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTT < 1:1763015/150‑1 CTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTG > 1:803211/1‑150 CTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTG > 1:1863975/1‑150 CTCTTTTGAAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TTTC‑TTTAACTCCC‑TTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTTTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTG < 1:1445694/150‑1 TCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGC < 1:1082025/150‑1 TCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑CTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAA > 1:3463915/1‑125 CTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAANCCAACTTTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCA < 1:3772860/150‑1 TTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAG < 1:1565867/150‑1 TTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑CTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTT‑AACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAG > 1:1693111/1‑150 TTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGCA‑CT‑C‑TTCAACTCCCCTTGCCCTCTCGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTG > 1:597003/1‑102 TGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑CTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTT‑AACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTG > 1:1314015/1‑150 GCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGC > 1:2141109/1‑150 CAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCT > 1:3219742/1‑150 GTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAGGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGC < 1:3266785/150‑1 TTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCG < 1:1584504/150‑1 GCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCA < 1:1945595/150‑1 GCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCA > 1:1718643/1‑150 GCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑CCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCA < 1:11080/150‑1 TGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAAC > 1:3232749/1‑112 TGTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTT‑AACTCCCCTTGAACTTTAGCGATT < 1:857658/105‑1 GTA‑TT‑C‑TTTAACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCct > 1:468087/1‑148 attcC‑TTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACCGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCAAACTGTATTCTTTA > 1:774790/5‑150 cC‑TTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAATTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACt > 1:409057/2‑149 cC‑TTTAAC‑CCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAATTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAGCTTTAGCGATTAGTGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACt > 1:409055/2‑149 ||| CCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTTAACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTA‑TT‑C‑TTTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen36_14/47761‑47623‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTTGAGCTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCCTT‑AACTCCCCTTGAACTTTAGCGATTAGGGGCTCTTTTGCAGTTGCTGCGCAAGCAAGCCAACTGTATTCTTTAACC < Xen36_14/47761‑47622 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |