| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_184 | = 473 | 0 (0.000) | 44 (0.100) | 30/234 | 1.5 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_60 | 32 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+159) | –/hisI | –/Histidine biosynthesis bifunctional protein HisIE | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTTACTTCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCACACCTGCTCA > Xen14_60/1‑181 | agaaagttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaacgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATgg < 1:1546846‑M2/48‑1 (MQ=255) gaaagttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGgc < 1:2347534‑M2/49‑1 (MQ=255) aaagttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGgcg > 1:3287737‑M2/101‑150 (MQ=255) agttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTTAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATAGCGCa > 1:2464923‑M2/99‑150 (MQ=255) tgaaggatttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCt < 1:3214934‑M2/55‑1 (MQ=255) tgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCt < 1:1801722‑M2/55‑1 (MQ=255) tgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCt < 1:1801720‑M2/55‑1 (MQ=255) tgaaagacttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCt < 1:2883182‑M2/55‑1 (MQ=255) gaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCtt > 1:376220‑M2/95‑150 (MQ=255) aaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcacgttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTa > 1:3453628‑M2/94‑150 (MQ=255) aagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTAt < 1:76836‑M2/58‑1 (MQ=255) aagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTAt > 1:2276148‑M2/93‑150 (MQ=255) gagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATcc < 1:186525‑M2/60‑1 (MQ=255) gttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcgaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCgg > 1:1608099‑M2/89‑150 (MQ=255) gttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcgaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCgg > 1:1608096‑M2/89‑150 (MQ=255) tttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGcc < 1:3283830‑M2/64‑1 (MQ=255) gccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTAc > 1:4228723‑M2/84‑150 (MQ=255) ccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgagtgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGGTTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACg > 1:3750356‑M2/83‑150 (MQ=255) gtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACgtg < 1:2203912‑M2/70‑1 (MQ=255) tagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACgtgt > 1:2820015‑M2/80‑150 (MQ=255) aatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTg < 1:2233136‑M2/75‑1 (MQ=255) atgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTga < 1:1469704‑M2/76‑1 (MQ=255) atgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTga < 1:308503‑M2/76‑1 (MQ=255) gcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAgatga < 1:1570890‑M2/81‑3 (MQ=255) cctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTATCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAAt < 1:357525‑M2/82‑1 (MQ=255) cctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAAt < 1:357527‑M2/82‑1 (MQ=255) ctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAAtg < 1:863051‑M2/83‑1 (MQ=255) ctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAAtg < 1:2781377‑M2/83‑1 (MQ=255) gcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAAtgtg < 1:289779‑M2/85‑1 (MQ=255) gcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAAtgtg < 1:289782‑M2/85‑1 (MQ=255) atgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTa < 1:1209710‑M2/87‑1 (MQ=255) atgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTa < 1:3358260‑M2/87‑1 (MQ=255) tgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAg > 1:3266111‑M2/63‑150 (MQ=255) gtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGc < 1:3911584‑M2/99‑1 (MQ=255) taatgatttgcagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCt < 1:4017074‑M2/100‑1 (MQ=255) taatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCt < 1:3469559‑M2/100‑1 (MQ=255) taatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCt < 1:1816863‑M2/100‑1 (MQ=255) tgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTgc < 1:2277424‑M2/103‑1 (MQ=255) tgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTgc < 1:1661210‑M2/103‑1 (MQ=255) gatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTgcg < 1:3244185‑M2/104‑1 (MQ=255) gatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTgcg < 1:454362‑M2/104‑1 (MQ=255) acagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCg < 1:3473745‑M2/109‑1 (MQ=255) agcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCggg > 1:2346125‑M2/40‑150 (MQ=255) ggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCaa > 1:53103‑M2/37‑150 (MQ=255) aCTTCAAATGAATGTTTCATANACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCggg > 1:3511216/1‑150 (MQ=255) cTTCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGgt > 1:4145821/1‑150 (MQ=255) cTTCAAACGAATGCTCCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGgt < 1:3750788/150‑1 (MQ=255) tCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGgtgt > 1:245954/1‑150 (MQ=255) tCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTATAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGgtgt < 1:2105864/150‑1 (MQ=255) cAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGtgtg < 1:1074236/150‑1 (MQ=255) cAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGtgtg < 1:1074238/150‑1 (MQ=255) cAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGtgtg < 1:3508088/150‑1 (MQ=255) aaaTGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCCATGGCTCCGGGTGTgg > 1:2985412/1‑150 (MQ=255) aatgTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGcaaca < 1:1601391/150‑1 (MQ=255) aatgTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGcaaca < 1:1601395/150‑1 (MQ=255) atgTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGcaacaa > 1:3842274/1‑150 (MQ=255) atgTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGcaacaa > 1:3216373/1‑150 (MQ=255) atgTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTANGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGcaacaa > 1:3894001/1‑150 (MQ=255) cATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATcac < 1:157284/150‑1 (MQ=255) cATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATcac > 1:3481005/1‑150 (MQ=255) tAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATg > 1:304808/1‑123 (MQ=255) tAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCacac > 1:3145424/1‑150 (MQ=255) gTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCACACCTGCTc < 1:3795468/150‑1 (MQ=255) tACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCTGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCACACCTGCTCa > 1:3213475/1‑150 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTTACTTCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCACACCTGCTCA > Xen14_60/1‑181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |