| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_159 | = 729 | 45 (0.310) | 43 (0.380) | 28/296 | 2.9 | 38.2% | intergenic (+397/–) | Xen14_04769/– | hypothetical protein/– |
| ? | Xen14_60 | = 18896 | 94 (1.110) | intergenic (+512/+385) | Xen14_04101/yeeW | hypothetical protein/Protein YeeW | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
ACGGTATCGATCCGGAAGCGTATCTGCGCCATATTCTGAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTACCCAGACCGTGGATTTGGAATTCATTTTTTGTCAGGTCAATGCTAATCGTTAAAACGGCCATAACGCACCTCCACTGGAAGGTTTATCAGTAATATCCTACCGTTGCTTCA > Xen14_60/18754‑19045 | ggTATCGATCCGGAAGCGTATCTGCGCCATATTCTGAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACTTTAATCCg > 1:1930306/1‑150 (MQ=255) ggTATCGATCCGGAAGCGTATCTGCGCCATATTCTGAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACTTTAATCCg > 1:974643/1‑150 (MQ=255) ggTATCGATCCGGAAGCGTATCTGCGCCATATTCTGAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACTTTAATCCg > 1:678603/1‑150 (MQ=255) tATCGATCCGGAAGCGTATCTGTGCCATATTCTGAGCGTACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTACTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACcgataattaaa < 1:58345‑M2/150‑12 (MQ=255) tATCGATCCGGAAGCGTATCTGCGCCATATTCTGAGCGTACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTACTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACcgataattaaa < 1:772814‑M2/150‑12 (MQ=255) tATCGATCCGGAAGCGTATCTGCGCCATATTCTGAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACTT‑AATCCGttt < 1:3723197/150‑1 (MQ=255) atcaaTCCGGAAGCGTATCTGCGCCCTATTCTGAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGATTACTTTAATCCGttt > 1:1591143/5‑150 (MQ=255) tCGATCCGGAAGCGTATCTGCGCCATATTCTGAGCGTACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTACTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACcgataattaaagc > 1:1911204‑M2/1‑137 (MQ=255) tCGATCCGGAAGCGTATCTGCGCCATATTCTGAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACTTTAATCCGtttt < 1:2682859/150‑1 (MQ=255) 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cATATTCTGAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTcc > 1:1123740/1‑150 (MQ=255) atTCTGAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTAc > 1:4059312/1‑150 (MQ=255) atTCTGAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTAc > 1:2105271/1‑150 (MQ=255) tCTGAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTAccc < 1:3483728/150‑1 (MQ=255) gAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACTGTGCTCCGTTGACGCTTACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTACCCAGa > 1:471774/1‑150 (MQ=255) 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tCCGTTGACGCTTACcgataattaaagccaccacggtcccgttcaggtcccatactcaaaccgaaagcactggataaccagattttaaggcgatgcaaatacgcagcctgaacagcctgattatattgttcaatttgatgttcaattaac > 1:1607610‑M2/1‑15 (MQ=255) tCCGTTGACGCTTACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTACCCAGACCGTGGATTTGGAATTCATTTTTTGTCAGGTCAATGCTAATCGTTAAAACGGCCATAACGCACCTCCACTGGAAGGTTTATCAGTAATATc > 1:3554892/1‑150 (MQ=255) ccGTTGACGCTTACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTACCCAGACCGTGGATTTGGAATTCATTTTTTGTCAGGTCAATGCTAATCGTTAAAACGGCCATAACGCACCTCCACTGGAAGGTTTATCAGTAATATcc < 1:762608/150‑1 (MQ=255) ccGTTGACGCCTACcgataattaaagccaccacggtcccgttcaggtcccatactcaaaccgaaagcactggataaccagattttagggcgatgcaaatacgcagcctgaacagcctgattatattgttcaatttgatgttcaattaacg > 1:3488898‑M2/1‑14 (MQ=255) gTTGACGCTTACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTACCCAGACCGTGGATTTGGAATTCATTTTTTGTCAGGTCAATGCTAATCGTTAAAACGGCCATAACGCACCTCCACTGGAAGGTTTATCAGTAATATCCTa > 1:4092308/1‑150 (MQ=255) ttGACGCTTACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTACCCAGACCGTGGATTTGGAATTCATTTTTTGTCAGGTCAATGCTAATCGTTAAAACCGCCATAACGCACCTCCACTGGAAGGTTTATCAGTAATATCCTAc < 1:77578/150‑1 (MQ=255) ttACcgataattaaagccaccacggtcccgttcaggtcccatactcaaaccgaaagcactggataaccagattttaaggcgatgcaaatacgcagcctgaacagcctgattatattgttcaatttgatgttcaattaacgctctatcgcc < 1:1428668‑M2/150‑147 (MQ=255) ttACcgataattaaagccaccacggtcccgttcaggtcccatactcaaaccgaaagcactggataaccagattttaaggcgatgcaaatacgcagcctgaacagcctgattatattgttcaatttgatgttcaattaacgctctatcgcc < 1:1428672‑M2/150‑147 (MQ=255) ttACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTACCCAGACCGTGGATTTGGAATTCATTTTTTGTCAGGTCAATGCTAATCGTTAAAACGGCCATAACGCACCTCCACTGGAAGGTTTATCAGTAATATCCTACCGTTGCt < 1:2888159/150‑1 (MQ=255) ttACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTACCCAGACCGTGGATTTGGAATTCATTTTTTGTCAGGTCAATGCTAATCGTTAAAACGGCCATAACGCACCTCCACTGGAAGGTTTATCAGTAATATCCTACCGTTGCt < 1:2888157/150‑1 (MQ=255) cTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTACCCAGACCGTGGATTTGGAATTCATTTTTTGTCAGGTCAATGCTAATCGTTAAAACGGCCATAACGCACCTCCATTGGAAGGTTTATCAGTAATATCCTACCGTTGCTTCa > 1:46173/1‑150 (MQ=255) | ACGGTATCGATCCGGAAGCGTATCTGCGCCATATTCTGAGCATACTGCCGGAATGGCCCTCCAACCGTGTTGACGAACTCCTGCCATGGAACGTAGTTCTCACCAATAAATAAGCGTCAATACGGTGCTCCGTTGACGCTTACTTTAATCCGTTTTCTGAGCTTAGATTTTTCTGTTCCTACCCAGACCGTGGATTTGGAATTCATTTTTTGTCAGGTCAATGCTAATCGTTAAAACGGCCATAACGCACCTCCACTGGAAGGTTTATCAGTAATATCCTACCGTTGCTTCA > Xen14_60/18754‑19045 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |