| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_159 | = 729 | 45 (0.310) | 43 (0.380) | 28/296 | 2.9 | 38.2% | intergenic (+397/–) | Xen14_04769/– | hypothetical protein/– |
| ? | Xen14_60 | = 18896 | 94 (1.110) | intergenic (+512/+385) | Xen14_04101/yeeW | hypothetical protein/Protein YeeW | |||||
GGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_159/584‑729‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGATA < Xen14_60/18896‑18758 GGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAA < 1:1428668/150‑1GGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAA < 1:1428672/150‑1 CGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCCTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAGGCGTCAACGG > 1:3488898/1‑150 GTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGA > 1:817185/1‑150 GTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGA > 1:1607610/1‑150 ACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTAT > 1:989208/1‑150 CAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCATAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGAC < 1:731595/150‑1 AAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACG < 1:3799118/150‑1 AAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACG < 1:1907907/150‑1 AATTGAACAATATAATCATGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGGGTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGC < 1:2262920/150‑1 AATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGC < 1:1339322/150‑1 TTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCATGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTT < 1:363451/150‑1 TTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCATGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTT < 1:1987797/150‑1 ACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTCTTT > 1:1908159/1‑150 atacaaccatGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCA < 1:430234/119‑1 ATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTA < 1:2117226/148‑1 ATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGG < 1:210144/150‑1 AATCAGGCTGTTCATGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTG < 1:492638/150‑1 AATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTG < 1:2737143/150‑1 TCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAG < 1:922481/150‑1 TCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAG < 1:47716/150‑1 GTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTT > 1:3345657/1‑119 GTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGG < 1:161781/150‑1 CCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATT > 1:1542524/1‑150 CCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGCTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATT > 1:412822/1‑150 GCTTTTGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGC < 1:3649531/150‑1 GCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGC < 1:2637375/150‑1 GCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGC < 1:3949791/150‑1 CTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCA < 1:3373764/150‑1 TTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAG < 1:1907003/150‑1 TTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTCGGAGGGCCATTCCGGCAG > 1:188634/1‑150 TTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTCGGAGGGCCATTCCGGCAG > 1:188631/1‑150 TTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGT > 1:3057851/1‑150 GTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTAcgc > 1:4024876/1‑147 GGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATG < 1:790782/150‑1 CCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGC < 1:179214/150‑1 CTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCA < 1:3989050/150‑1 GCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGA > 1:1911204/1‑150 CTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACAAGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGAT > 1:673336/1‑150 TTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGATA < 1:772812/150‑1 TTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGATA < 1:772814/150‑1 TTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGATA < 1:2650471/150‑1 TTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCACAGATACGCTTCCGGATCGATA < 1:58345/150‑1 GGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_159/584‑729‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGATA < Xen14_60/18896‑18758 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |