| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_131 | 846 = | 36 (0.500) | 49 (0.440) | 32/296 | 1.4 | 73.1% | coding (93/573 nt) | Xen14_04737 | hypothetical protein |
| ? | Xen14_151 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑66) | –/Xen14_04764 | –/hypothetical protein | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGCTACG > Xen14_151/1‑150 | acgcatctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGc < 1:336788‑M2/2‑1 (MQ=255) catctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCgg > 1:1184785‑M2/146‑150 (MQ=255) catctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCgg > 1:1184786‑M2/146‑150 (MQ=255) catctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCgg > 1:1184787‑M2/146‑150 (MQ=255) catctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCgg < 1:2359406‑M2/5‑1 (MQ=255) atctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCggg < 1:970119‑M2/6‑1 (MQ=255) tctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaacgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGc > 1:1619796‑M2/144‑150 (MQ=255) tgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGt < 1:1759504‑M2/9‑1 (MQ=255) ctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccggacgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGCGAt > 1:392573‑M2/139‑150 (MQ=255) ggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCaggt < 1:2776760‑M2/18‑2 (MQ=255) gatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacgcagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGaa < 1:3934514‑M2/21‑1 (MQ=255) gatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCAGGGCGTGATGCAGGTGaa < 1:322344‑M2/21‑1 (MQ=255) caacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGaa > 1:2535936‑M2/124‑150 (MQ=255) 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ctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGa > 1:3400822‑M2/81‑150 (MQ=255) gtcagaaactgaacgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGgtg > 1:1052113‑M2/39‑150 (MQ=255) aactgaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTc > 1:3299507‑M2/33‑150 (MQ=255) ctgaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAg < 1:2149175‑M2/120‑1 (MQ=255) gaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGc > 1:762044‑M2/29‑150 (MQ=255) atgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGgtgt < 1:696123‑M2/113‑1 (MQ=255) atgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGgtgt < 1:2298404‑M2/113‑1 (MQ=255) gagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTg < 1:2697522‑M2/126‑1 (MQ=255) agggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGc > 1:2460479‑M2/24‑150 (MQ=255) ggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTg > 1:325870‑M2/22‑150 (MQ=255) ctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTCCAGGCAGTGCTggg > 1:828759‑M2/20‑150 (MQ=255) ctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTCCAGGCAGTGCTggg > 1:828761‑M2/20‑150 (MQ=255) tggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGt < 1:3377752‑M2/132‑1 (MQ=255) tatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTgcg < 1:1123571‑M2/135‑1 (MQ=255) atcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTgcgg > 1:2891430‑M2/15‑150 (MQ=255) 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gcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGAt < 1:4056266‑M2/143‑1 (MQ=255) gcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGAt < 1:2720921‑M2/143‑1 (MQ=255) gcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGAt < 1:2574288‑M2/143‑1 (MQ=255) cgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGAtt < 1:1990671‑M2/144‑1 (MQ=255) cattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGc > 1:3556315‑M2/5‑150 (MQ=255) tGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGCTAc > 1:202067‑M2/2‑150 (MQ=255) gCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCCGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGTTACg > 1:3954625/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGCTACg > 1:2810293/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGCTACg < 1:1978189/150‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGCTACG > Xen14_151/1‑150 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |