| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_131 | 846 = | 36 (0.500) | 49 (0.440) | 32/296 | 1.4 | 73.1% | coding (93/573 nt) | Xen14_04737 | hypothetical protein |
| ? | Xen14_151 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑66) | –/Xen14_04764 | –/hypothetical protein | |||||
GCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGCTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_131/993‑846‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGCTAC > Xen14_151/1‑149 aCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGC < 1:336788/149‑1 CATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGG < 1:2359406/150‑1 CATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGG > 1:1184787/1‑150 CATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGG > 1:1184786/1‑150 CATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGG > 1:1184785/1‑150 ATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGG < 1:970119/150‑1 TCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAACGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGC > 1:1619796/1‑150 TGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGT < 1:1759504/150‑1 CTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGACGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGCGAT > 1:392573/1‑150 GGGGATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGt < 1:2776760/150‑2 GATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACGCAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGTGAA < 1:3934514/150‑1 GATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCAGGGCGTGATGCAGGTGAA < 1:322344/150‑1 CAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAA > 1:2535936/1‑150 ACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATT < 1:1920976/150‑1 GATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTAT > 1:3189826/1‑150 GATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGG‑CTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGACGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATC > 1:2518761/1‑150 TTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCT > 1:3815117/1‑150 GCCGCCGCATCGACCTTCGTGTAAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCC > 1:1672020/1‑150 gtaAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCA > 1:1771801/4‑150 gtaAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCATCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCA > 1:2154553/4‑150 GGCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACAGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGT > 1:3025909/1‑150 GCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTG > 1:761956/1‑150 GCTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTG > 1:761955/1‑150 CTGAAGCCATCCGGGCGTTGTCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAATGACGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGA > 1:3400822/1‑150 GTCAGAAACTGAACGAGGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTG > 1:1052113/1‑150 aactgaatgagGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTC > 1:3299507/12‑150 ctgaatgagGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAG < 1:2149175/141‑1 gaatgagGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGC > 1:762044/8‑150 atgagGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGT < 1:696123/134‑1 atgagGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGT < 1:2298404/134‑1 gagGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTG < 1:2697522/147‑1 agGGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGC > 1:2460479/3‑150 GGCTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTG > 1:325870/1‑150 CTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTCCAGGCAGTGCTGGG > 1:828759/1‑150 CTGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTCCAGGCAGTGCTGGG > 1:828761/1‑150 TGGTATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGT < 1:3377752/150‑1 TATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCG < 1:1123571/150‑1 ATCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGG > 1:2891430/1‑150 TCAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGC < 1:1445355/150‑1 CAGGTGCGCATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCG > 1:3966589/1‑150 aggtgcgcATTGCCGGGCGGGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGC < 1:3032496/142‑1 ggtgcgcATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAAT‑ATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTG < 1:2953379/143‑1 gcgcATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGAT < 1:3047991/146‑1 gcgcATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGAT < 1:4056266/146‑1 gcgcATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGAT < 1:2720921/146‑1 gcgcATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGAT < 1:2574288/146‑1 cgcATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATT < 1:1990671/147‑1 cATTGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGC > 1:3556315/2‑150 TGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGCTAC > 1:202067/1‑150 GCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGCCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCGCTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_131/993‑846‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGCTAC > Xen14_151/1‑149 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |