| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_124 | 1 = | 0 (0.000) | 104 (0.700) +A |
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| ? | Xen14_165 | = 691 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
ATTGTGACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_165/543‑691 | aTTGTGACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGt > 1:2941128‑M2/1‑149 (MQ=255)aTTGTGACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGc < 1:410383‑M2/150‑2 (MQ=255) tgtgACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTT‑GTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcatt < 1:3422198‑M2/150‑5 (MQ=255) gtgACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtatt > 1:4192852‑M2/1‑146 (MQ=255) gACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattcc < 1:3874142‑M2/150‑7 (MQ=255) gACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattcc < 1:218393‑M2/150‑7 (MQ=255) gACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattcc < 1:218388‑M2/150‑7 (MQ=255) cATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattc < 1:1095539‑M2/150‑11 (MQ=255) cATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattc < 1:1369837‑M2/150‑11 (MQ=255) cATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCCGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGTGTTTCTTTATACGCCGtattccattc < 1:2683057‑M2/150‑11 (MQ=255) aTCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattct < 1:3008248‑M2/150‑12 (MQ=255) cTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattcttt > 1:130098‑M2/1‑137 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATANGCCGtattccattctttaa > 1:3860989‑M2/1‑135 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaa > 1:537240‑M2/1‑135 (MQ=255) ccTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaat > 1:709589‑M2/1‑134 (MQ=255) ccTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaat > 1:418413‑M2/1‑134 (MQ=255) ccTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCCTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaat > 1:368452‑M2/1‑134 (MQ=255) cTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaatt < 1:3982024‑M2/150‑18 (MQ=255) tGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaaga > 1:3644721‑M2/1‑129 (MQ=255) gTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaagagg > 1:204949‑M2/1‑127 (MQ=255) gCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaattaagagggtg > 1:1193044‑M2/1‑124 (MQ=255) aGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaattaagagggtgat > 1:4035742‑M2/1‑122 (MQ=255) aGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaattaagagggtgat < 1:1154107‑M2/150‑29 (MQ=255) gTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaagagggtgatt > 1:2226438‑M2/1‑121 (MQ=255) tCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaagagggtgatttatgg > 1:3306645‑M2/1‑116 (MQ=255) ccTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaagagggtgatttatggc < 1:2924343‑M2/150‑36 (MQ=255) cTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaattaagagggtgatttatggct < 1:3059022‑M2/150‑37 (MQ=255) cGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaagagggtgatttatggctat < 1:3362726‑M2/150‑39 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |