| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_124 | 1 = | 0 (0.000) | 104 (0.700) +A |
68/294 | 0.8 | 100% | intergenic (–/‑29) | –/Xen14_04720 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_165 | = 691 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTGCCGGGTTCTGGCAAATCTTATGAAGTGGTTAAGTCTGTTATTATTCCGGCTGTTGCATCCGGCCGAAGGATTGTCTCAAATATATACGGACT > Xen14_124/1‑148 | ttgtgactcatcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgca > 1:2389626‑M1/150‑150 (MQ=255) tgtgactcatcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgtttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcatt < 1:3422198‑M1/3‑1 (MQ=255) gtgactcatcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtAtt > 1:4192852‑M1/148‑150 (MQ=255) gactcatcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcattcc < 1:218392‑M1/5‑1 (MQ=255) catcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTc < 1:1095539‑M1/9‑1 (MQ=255) catcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTc < 1:1369837‑M1/9‑1 (MQ=255) atcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCt < 1:3008248‑M1/10‑1 (MQ=255) cttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCttt > 1:130098‑M1/139‑150 (MQ=255) cttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCttt < 1:384694‑M1/12‑1 (MQ=255) tcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTttaa > 1:537240‑M1/137‑150 (MQ=255) cctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTttaat > 1:709589‑M1/136‑150 (MQ=255) cctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTttaat > 1:418413‑M1/136‑150 (MQ=255) cctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcctaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgcngtATTCCATTCTttaat > 1:2221366‑M1/136‑150 (MQ=255) cctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcctaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTttaat > 1:368451‑M1/136‑150 (MQ=255) tggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAaga < 1:3517978‑M1/20‑1 (MQ=255) gtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAgg > 1:2908818‑M1/129‑150 (MQ=255) gtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAgg > 1:3590582‑M1/129‑150 (MQ=255) gtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAgg > 1:204944‑M1/129‑150 (MQ=255) tagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAggg < 1:2073227‑M1/23‑1 (MQ=255) gcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTg > 1:1193044‑M1/126‑150 (MQ=255) agtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGAt < 1:1154107‑M1/27‑1 (MQ=255) ttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATg > 1:378564‑M1/119‑150 (MQ=255) tcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATgg > 1:2800184‑M1/118‑150 (MQ=255) tcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATgg > 1:3306645‑M1/118‑150 (MQ=255) ctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCt < 1:3059022‑M1/35‑1 (MQ=255) cgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTAt < 1:3362726‑M1/37‑1 (MQ=255) ttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTAc < 1:1727588‑M1/40‑1 (MQ=255) ttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTAc < 1:838133‑M1/40‑1 (MQ=255) tttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGc > 1:3139020‑M1/108‑150 (MQ=255) tttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGc > 1:1804205‑M1/108‑150 (MQ=255) ttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTCAGGGGGTGGTTTATGGCTATTACTGCa < 1:3807687‑M1/44‑1 (MQ=255) ttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCa > 1:2438572‑M1/107‑150 (MQ=255) gccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGc < 1:3691173‑M1/53‑1 (MQ=255) ccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCg < 1:3244179‑M1/54‑1 (MQ=255) ccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGc > 1:1032375‑M1/97‑139 (MQ=255) cttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGt < 1:1256733‑M1/55‑1 (MQ=255) ttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTg > 1:2938784‑M1/95‑150 (MQ=255) tcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTGc < 1:3479120‑M1/57‑1 (MQ=255) tcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTGc > 1:1561374‑M1/94‑150 (MQ=255) cttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcctttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAgg < 1:4202982‑M1/22‑1 (MQ=255) ctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTGCCggg > 1:203520‑M1/90‑150 (MQ=255) ctccggtgtacattaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTAATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTGCCGGGTTc < 1:175570‑M1/64‑1 (MQ=255) ttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTGCCGGGTTCTg > 1:887565‑M1/85‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |