| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_12 | 25 = | 963 (11.610) | 61 (0.050) | 46/280 | 0.6 | 11.8% | intergenic (–/+303) | –/Xen14_01540 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_166 | = 677 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 3446 total aligned reads displayed.
TCGTCAGCCATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_166/528‑685 | tCGTCAGCCATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGc > 1:868129/1‑150 (MQ=255) cGTCAGCCATTACGAGCGACGCTGGCCGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCt > 1:2952793/1‑150 (MQ=255) tCAGCCATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTgg > 1:2571643/1‑150 (MQ=255) tCAGCCATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAACGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTGTCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTgg < 1:3433025/150‑1 (MQ=255) cAGCCATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTggg < 1:2263153/150‑1 (MQ=255) cAGCCATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGATGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTggg < 1:3679051/150‑1 (MQ=255) aGCCATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACATGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGc < 1:4105050/150‑1 (MQ=255) gCCATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGcc > 1:1392832/1‑150 (MQ=255) gCCATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGcc > 1:1592862/1‑150 (MQ=255) ccATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGATGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCt > 1:831558/1‑150 (MQ=255) ttACGAGTGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcg < 1:2914544‑M1/150‑3 (MQ=255) aCGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggc < 1:2469403‑M1/150‑5 (MQ=255) gAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATACACTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcag > 1:3068459‑M1/1‑144 (MQ=255) gAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcag > 1:1200458‑M1/1‑144 (MQ=255) 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cGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATATGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggc > 1:1917177‑M1/1‑141 (MQ=255) aCGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcgg < 1:587573‑M1/150‑12 (MQ=255) cGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCtgggcctgtctgaaactggc > 1:384632‑M2/1‑130 (MQ=255) cGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggt > 1:1561100‑M1/1‑138 (MQ=255) gctggctgATAGAGGAATATCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggta < 1:3483994‑M1/150‑14 (MQ=255) ctggctgATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtat < 1:4186530‑M1/150‑15 (MQ=255) tggctgATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatc > 1:211176‑M1/1‑135 (MQ=255) ctgATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagt > 1:330587‑M1/1‑132 (MQ=255) ctgATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagt > 1:946273‑M1/1‑132 (MQ=255) gATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtga < 1:199152‑M1/150‑21 (MQ=255) aTAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaa < 1:3383401‑M1/150‑22 (MQ=255) tAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaag > 1:2672693‑M1/1‑128 (MQ=255) agagGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaaga > 1:1161926‑M1/1‑127 (MQ=255) gagGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaa > 1:1085826‑M1/1‑126 (MQ=255) gagGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaa > 1:3771076‑M1/1‑126 (MQ=255) 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aTACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacaca > 1:2342311‑M1/1‑121 (MQ=255) ccACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaa > 1:253857‑M1/1‑118 (MQ=255) cacaAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaat > 1:134350‑M1/1‑117 (MQ=255) caAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTATGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatga > 1:3741491‑M1/1‑115 (MQ=255) ggCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacag > 1:2381075‑M1/1‑112 (MQ=255) 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ggtggtACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaata > 1:1123808‑M1/1‑99 (MQ=255) ggtggtACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaata > 1:1302706‑M1/1‑99 (MQ=255) ggtggtACATGGGTGGAATCACTGCGAATGAAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagggaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaaga < 1:3606365‑M1/150‑52 (MQ=255) ggtACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaatactg < 1:1949981‑M1/150‑55 (MQ=255) cATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaatactgacgc < 1:1422098‑M1/150‑59 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |