| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_12 | 25 = | 963 (11.610) | 61 (0.050) | 46/280 | 0.6 | 11.8% | intergenic (–/+303) | –/Xen14_01540 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_166 | = 677 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1063 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCT > Xen14_12/1‑175 | gcgacgctggctgatagaggaataccacaaggcgtggaaaagtggtggtacatgtgtggaatcgctgcgaatgcagacccgggataacctcgagcgcatggtggttatcaaggcgtttatcgcggtgcgggtgcTGGGCCTGTCTGAAAc > 1:1092870‑M1/135‑150 (MQ=255) cgacgctggctgatagaggaataccacaaggcgtggaaaagtggtggtacatgtgtggaatcgctgcgaatgcagacccgggataacctcgagcgcatggtggttatcaaggcgtttatcgcggtgcgggtgcTGGGCCTGTCTGAAACt < 1:433050‑M1/17‑1 (MQ=255) aataccacaaggcgtggaaaagtggtggtacatgtgtggaatcgctgcgaatgcagacccgggataacctcgagcgcatggtggttatcaaggcgtttatcgcggtgcgggtgcTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATgg < 1:835524‑M1/36‑1 (MQ=255) aatcgctgcgaatgcagacccgggataacctcgagcgcatggtggttatcaaggcgtttatcgcggtgcgggtgcTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTc < 1:801775‑M1/75‑1 (MQ=255) aggaaaaccgcttccGTCACATATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTCCAGACTTCAGGATATGGTTGa < 1:3184598/137‑1 (MQ=14) aggaaaaccgcttccGTCACAGCTGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGa > 1:3887643/14‑150 (MQ=14) aggaaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGa < 1:2068802/137‑1 (MQ=255) tgaaaaccgcttccGTCACAGATGTCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGTATGACAACAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAg < 1:4172441/138‑1 (MQ=14) ggaaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCNTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAg < 1:3669280/138‑1 (MQ=255) 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acacTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGTTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGAt < 1:1695885/150‑1 (MQ=255) cacTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATc < 1:488360/150‑1 (MQ=255) cTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACATCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAg < 1:1242733/150‑1 (MQ=255) cTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAg < 1:856221/150‑1 (MQ=255) cTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAg < 1:142977/150‑1 (MQ=255) 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gAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGga < 1:769097/150‑1 (MQ=255) aaaTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCGAACGCACCGGTCGCCCCAGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGgag < 1:1397339/150‑1 (MQ=255) aaaTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCTCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGgag < 1:2587218/150‑1 (MQ=255) aaaTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCTGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGgag < 1:3557570/150‑1 (MQ=255) aaaTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGgag < 1:222296/150‑1 (MQ=255) 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tGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATc < 1:2515033/150‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCT > Xen14_12/1‑175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |