| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
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Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
AGTGCTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_177/400‑549 | aCCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaa < 1:308714‑M1/150‑7 (MQ=255) ccTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaa < 1:489184‑M1/150‑8 (MQ=255) ccTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaa > 1:3312017‑M1/1‑143 (MQ=255) 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tACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtcca < 1:518052‑M1/150‑20 (MQ=255) aaCGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaa > 1:1214545‑M1/1‑128 (MQ=255) tagtaCCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggag < 1:1649868‑M1/150‑27 (MQ=255) tagtaCCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggag < 1:1649869‑M1/150‑27 (MQ=255) agtaCCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagt < 1:2514943‑M1/150‑28 (MQ=255) agtaCCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagt < 1:2514942‑M1/150‑28 (MQ=255) gtaCCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtt < 1:1275162‑M1/150‑29 (MQ=255) gtaCCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtcaataaggagtt > 1:3517147‑M1/1‑122 (MQ=255) taCCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTGTGGgctaaaacaacaaagtccataaggagttt < 1:3992910‑M1/150‑30 (MQ=255) aCCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagttta > 1:597468‑M1/1‑120 (MQ=255) aTTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactc > 1:32213‑M1/1‑117 (MQ=255) aTTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactc < 1:463202‑M1/150‑34 (MQ=255) aTTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactc > 1:2092318‑M1/1‑117 (MQ=255) tCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcac < 1:1662024‑M1/150‑36 (MQ=255) cAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATggac < 1:1770613/116‑3 (MQ=255) aTAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccata > 1:4018314‑M1/1‑112 (MQ=255) aaaCATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctga < 1:2927962‑M1/150‑42 (MQ=255) tCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATCGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaat < 1:850496‑M1/150‑48 (MQ=255) cTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatc > 1:2580901‑M1/1‑102 (MQ=255) cTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtacataaggagtttactcacatctgacaaaatc > 1:658017‑M1/1‑102 (MQ=255) cTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACATATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactc < 1:3812355‑M1/135‑34 (MQ=255) tGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatca > 1:3902669‑M1/1‑101 (MQ=255) gAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaat > 1:3287136‑M1/1‑99 (MQ=255) tttAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAGTATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatata < 1:1172459‑M1/150‑55 (MQ=255) tAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaa < 1:3630877‑M1/150‑57 (MQ=255) tAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaa > 1:2073496‑M1/1‑94 (MQ=255) tAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaa > 1:2073497‑M1/1‑94 (MQ=255) aTCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaaca < 1:2436026‑M1/150‑59 (MQ=255) tCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacag > 1:591642‑M1/1‑91 (MQ=255) aaaaaCAGCCAGGAATGTCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcc > 1:623602‑M1/1‑89 (MQ=255) aaaaaCAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTNATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGNactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcc > 1:3724204‑M1/1‑89 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |