| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_177 | = 549 | 0 (0.000) | 82 (0.860) +GCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAAC |
52/182 | 0.1 | 82.4% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_96 | 5541 = | 57 (0.460) | intergenic (‑234/+256) | Xen14_04570/Xen14_04571 | hypothetical protein/tRNA‑Arg(tct) | |||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
ACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_177/406‑549‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCACGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATTGCCCCTCCGCACAGGGGGATTCACCA > Xen14_96/5541‑5688 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGACTAAA < 1:308714/150‑1 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1:2514943/150‑1 GTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCAATAAGGAGTT > 1:3517147/1‑150 TACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTGTGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTT < 1:3992910/150‑1 ATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTC > 1:32213/1‑150 ATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTC < 1:463202/150‑1 ATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGACTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTC < 1:645961/150‑1 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1:2073499/1‑150 TCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGACTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAG > 1:591638/1‑150 TCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGACTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAG > 1:591642/1‑150 AAAAACAGCCAGGAATGTCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCC > 1:623602/1‑150 AAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTNATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGNACTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCC > 1:3724204/1‑150 CAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAG < 1:916109/150‑1 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ACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTA > 1:2162999/1‑150 ACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTA > 1:2164002/1‑150 ACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCC > 1:1960515/1‑150 CAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCAATTATCCC < 1:3352297/150‑1 TCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATA < 1:1530414/150‑1 TCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATA < 1:3598395/150‑1 GAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCG < 1:1182069/150‑1 TTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTG < 1:2646261/150‑1 TACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTGAT < 1:1963624/150‑1 TCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATTGC > 1:1981706/1‑150 TCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATTGC < 1:2385666/150‑1 TCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAAAGGGGCTGGAGAGCGGCGCTATGTGCCATTGCGTGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATTGC < 1:2789888/150‑1 TCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATTGCCCCTC > 1:847537/1‑150 CTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATTGCCCCTCC > 1:3074087/1‑150 GACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATTGCCCCTCCGC > 1:716983/1‑150 GACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATTGCCCCTCCGC > 1:3241079/1‑150 TATAAACAGCCCCTTCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATTGCCCCTCCGCACAGctgtctc < 1:3763334/150‑8 TAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCCGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATCGCCCCTCCGCACAGGTGGATTCA > 1:525057/1‑150 AACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATTGCCCCTCCGCACAGGTGGATTCACC > 1:3268438/1‑150 ACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCGCGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATTGCCCCTCCGCACAGGTGGATTCACCA > 1:2690127/1‑150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_177/406‑549‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAATCCACGATTATCCCATATACCTACTCGCTGATTGCCCCTCCGCACAGGGGGATTCACCA > Xen14_96/5541‑5688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |