| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_126 | 2440 = | NA (NA) | 43 (0.430) +TCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTAGATTTGCCGTTCATAGATTGAGCCTCAGAT |
26/166 | 0.5 | 100% | intergenic (+148/–) | Xen14_04727/– | hypothetical protein/– |
| ? | Xen14_99 | = 6045 | 0 (0.000) | intergenic (‑484/–) | Xen14_04599/– | hypothetical protein/– | |||||
GAAGGAGGAGCAGTAATGGATTAAGTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACGGGCGTCATTAGTGCGAGCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_126/2291‑2515 | gAAGGAGGAGCAGTAATGGATTAAGTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTAttt < 1:4260961/150‑1 (MQ=255)gAAGGAGGAGCAGTAATGGATTAAGTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTAttt < 1:1595359/150‑1 (MQ=255) aaGGAGGAGCAGTAATGGATTAAGTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATATTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTg < 1:389958/150‑1 (MQ=255) aggaggAGCAGTAATGGATTAAGTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATCATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGt > 1:4177331/1‑150 (MQ=255) ggaggaGCAGTAATGGATTAAGTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTa > 1:4043649/1‑150 (MQ=255) aggagCAGTAATGGATTAAGTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATg < 1:2213436/150‑1 (MQ=255) aggagCAGTAATGGATTAAGTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATg > 1:2632543/1‑150 (MQ=255) aggagCAGTAATGGATTAAGTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATg > 1:1890748/1‑150 (MQ=255) ggagCAGTAATGGATTAAGTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTGAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCGAGTATTTGTATgg > 1:2893822/1‑150 (MQ=255) 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gTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCaa > 1:1036293/1‑150 (MQ=255) gTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCaa > 1:4079763/1‑150 (MQ=255) tGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAAt > 1:3890064/1‑150 (MQ=255) tGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAAt > 1:3890066/1‑150 (MQ=255) aTAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAAttt < 1:2173582/150‑1 (MQ=255) 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aaTAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTaaaa < 1:3810436/150‑1 (MQ=255) agGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAatatat < 1:2351254/150‑1 (MQ=255) agGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAatatat < 1:2002480/150‑1 (MQ=255) ggTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATAtt < 1:609389/150‑1 (MQ=255) tttAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTaaaa < 1:4158420/142‑1 (MQ=255) 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cTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTCAAATATATTCCACGGGCGTCATTAGTGCGAGCGccttgtgg > 1:2088491/1‑144 (MQ=255) cTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACGGGCGTCATTAGTGCGAGCGccttgtgg > 1:1738424/1‑144 (MQ=255) cTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACGGGCGTCATTAGTGCGAGCGccttgtgg > 1:431602/1‑144 (MQ=255) cTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACGGGCGTCATTAGTGCGAGCGccttgtgg > 1:1738429/1‑144 (MQ=255) cTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACGGGCGTCATTAGTGCGAGCGccttgtgg < 1:1910426/150‑7 (MQ=255) cTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACGGGCGTCATTAGTGCGAGCGccttgtgg > 1:1915718/1‑144 (MQ=255) ttttGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACGGGCGTCATTAGTGCGAGCGccttgtggggt > 1:1222791/1‑141 (MQ=255) ttttGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACGGGCGTCATTAGTGCGAGCGccttgtggggt > 1:1364166/1‑141 (MQ=255) gatgaAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACGGGCGTCATTAGTGCGAGCGccttgtggggtcttt < 1:3306277/150‑14 (MQ=255) atgaAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACGGGCGTCATTAGTGCGAGCGccttgtggggtctttt < 1:1731624/150‑15 (MQ=255) tCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACggg > 1:1260396/1‑100 (MQ=255) tCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACggg > 1:1260397/1‑100 (MQ=255) | GAAGGAGGAGCAGTAATGGATTAAGTGATAACAAATGCCCAGAAATAGAGGTTTAAATCCTGCTTAGTTAGTACATAAATACTATTTTGATGAAAATTATTATATGTCACCTCGGATTTTAATCAGGCGCCCAGATTAAATCAAGTATTTGTATGGGTCCACCACATATTGCAATTTTTATTCTCTTTTAAAATATATTCCACGGGCGTCATTAGTGCGAGCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_126/2291‑2515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |