| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_12 | = 189 | 97 (1.170) | 74 (0.990) | 41/294 | 0.6 | 43.4% | intergenic (–/+139) | –/Xen14_01540 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_21 | = 59 | NA (NA) | intergenic (–/+18) | –/add | –/Adenosine deaminase | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCATGAACGCAGAAGAAAAAATTCAGCCATCACGCAGTAA > Xen14_12/40‑338 | cTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAgg < 1:1333484/150‑1 (MQ=255)cTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAgg > 1:3320708/1‑150 (MQ=255) ggCGAACCTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATATGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTCACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGcg > 1:608723/1‑149 (MQ=255) ggCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGgg > 1:2561528‑M1/1‑148 (MQ=255) ggCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGgc > 1:3025261‑M1/1‑148 (MQ=255) ggCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGcc > 1:2769430/1‑149 (MQ=255) ggCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGcc > 1:2769428/1‑149 (MQ=255) gCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGgca > 1:3855085‑M1/1‑147 (MQ=255) gCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGcca > 1:1405223/1‑148 (MQ=255) gCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGACCAGGAGATCTGATCCAAAGACAggaac > 1:2570297/1‑147 (MQ=17) gCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCACCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGggt > 1:308495‑M1/1‑147 (MQ=255) gAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCACCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGccagt > 1:1454105/1‑146 (MQ=255) aaCTTGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGggtacag < 1:3802112‑M1/150‑8 (MQ=255) aaCTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAAc < 1:4137256/150‑1 (MQ=255) aaCTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAAc > 1:1383588/1‑150 (MQ=255) cTGGGGCGATGGCATGACAACAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTAAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGNTGAATTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGgcatagccg < 1:3897285‑M1/150‑10 (MQ=255) tGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGggtacagaga > 1:3361191‑M1/1‑140 (MQ=255) tGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGgcatagccgg < 1:548769‑M1/150‑11 (MQ=255) tGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGgcatagccgg > 1:2855028‑M1/1‑140 (MQ=255) tGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGATTACCTGGTGATGAAGTCTCCTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGggtacagaga > 1:71288‑M1/1‑140 (MQ=255) ggggCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAggttgcaggaagg < 1:166431/150‑12 (MQ=255) gggCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGggtacagagaga < 1:2791652‑M1/150‑13 (MQ=255) gggCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGggtacagagaga < 1:1797842‑M1/150‑13 (MQ=255) gggCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGccagtgagaggg > 1:133307/1‑139 (MQ=255) gggCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTCCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCCGATCAAGAGACAggttgcaggaaggg > 1:2452659/1‑138 (MQ=17) ggCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGgcatagccggagg < 1:1687904‑M1/150‑14 (MQ=255) ggCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGcgtga > 1:2800374/1‑138 (MQ=255) gCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGGGGGTGACCTGGTGAGGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGggtacagagagagg < 1:2753626‑M1/150‑15 (MQ=255) 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gATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGcgtgaagcgggggagt > 1:557011/1‑135 (MQ=17) gtgGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGCCATGGGGGATGACTGGTTCAGACTTAAGGATATGGTTGAGGGTTACATGGTGAGGAATTCTCGTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGgcatagccggaggtttt < 1:2509625‑M1/149‑18 (MQ=255) aTGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCGGGAGATCTGATCAAGAGAC‑GGCAttaagcagggatattc < 1:511510/150‑16 (MQ=17) aTGGCATGACAGCAAACACACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAATCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGgcatagccggaggtttt < 1:4220115‑M1/150‑18 (MQ=255) ggCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGgcatagccggaggtttttc < 1:2269351‑M1/150‑20 (MQ=255) 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gATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTc > 1:520540/1‑150 (MQ=255) cTGGTTCGGACTTCAGGATGTGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAATTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAgggg < 1:4198425/150‑1 (MQ=255) ttCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGttag > 1:193853/1‑147 (MQ=255) ttCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGttag > 1:193860/1‑147 (MQ=255) cAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCATGGGTCagtagt < 1:3955465/145‑1 (MQ=255) tatGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACgg < 1:626440/150‑1 (MQ=255) tGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGGTCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAACTCTGAACAGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTc > 1:3834308/1‑150 (MQ=255) ggTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCa < 1:869321/150‑1 (MQ=255) ggTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCa < 1:869325/150‑1 (MQ=255) ggTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCa > 1:3459451/1‑150 (MQ=255) gTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAAGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCAc > 1:2431998/1‑150 (MQ=255) tGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCt > 1:1186301/1‑150 (MQ=255) ggTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGc < 1:449295/150‑1 (MQ=255) gTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTAAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCg > 1:2898031/1‑150 (MQ=255) tACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGaa > 1:1111645/1‑150 (MQ=255) tgaAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCa > 1:1524964/1‑150 (MQ=255) tgaAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGACCCCCATACGCAGGGCAATTTCAATGGTCAGTAGTGCTTTCCCAGTCACCCCAGCGAACGATAtttca > 1:2243776/1‑147 (MQ=37) ctctTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCATGAACg < 1:1442140/150‑1 (MQ=255) ctctTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCACCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCGGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACATCAGCGAACGGTATTGCATGAACg > 1:3935753/1‑150 (MQ=255) ctTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTc > 1:3183485/1‑126 (MQ=255) ctTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCACACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCATGAACGCa > 1:1080166/1‑150 (MQ=255) aTCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGTGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCATGAACGCagaag < 1:1270122/150‑1 (MQ=255) aTCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCATGAACGCagaag > 1:643384/1‑150 (MQ=255) aGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCATGAACGCAGAAGaaa < 1:298192/150‑1 (MQ=255) ggAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCATGAACGCAGAAGaaaa < 1:1470169/150‑1 (MQ=255) gaTCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCATGAACGCAGAAGAAAAAAt > 1:2358274/1‑150 (MQ=255) gATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCATGAACGCAGAAGAAAAAAt < 1:2395607/145‑1 (MQ=255) | CTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCATGAACGCAGAAGAAAAAATTCAGCCATCACGCAGTAA > Xen14_12/40‑338 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |