| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_10 | = 471 | 565 (3.010) | 394 (2.780) | 157/268 | 0.0 | 60.6% | intergenic (–/+246) | –/hemG | –/Protoporphyrinogen IX dehydrogenase [menaquinone] |
| ? | Xen14_23 | = 73961 | 0 (0.000) | intergenic (+235/–) | gmhB/– | D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose‑1,7‑bisphosphate 7‑phosphatase/– | |||||
Only 100 of 963 total aligned reads displayed.
ATGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAGTTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGCGCGGGGTGTGCATAATACG‑CTTTCCCGCTACAGAGTCAAGCATTTTTT‑ACTTTTCTCTGCCGGAATTCTCAGGAGAACCCCGCTGACCCGGCGGCGTGCTTGCCGTTGT > Xen14_10/322‑620 | aTGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATaa > 1:3269192/1‑150 (MQ=255) gATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAat > 1:1508332‑M1/1‑148 (MQ=255) aTCAAATTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAgtt > 1:821759/1‑150 (MQ=255) aTCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAatt < 1:2204711‑M1/150‑4 (MQ=255) cAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgt > 1:320345‑M1/1‑145 (MQ=255) aaCTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAGTTGTTa < 1:2780628/150‑1 (MQ=255) ctTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattg < 1:1628796‑M1/143‑5 (MQ=255) ctTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattattaaaga < 1:429409‑M1/150‑12 (MQ=255) ttCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattattaaagag > 1:3348207‑M1/1‑138 (MQ=255) cAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAGTTGTTAAAGAGCa > 1:3233697/1‑150 (MQ=255) aaTTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcag < 1:946458‑M1/150‑16 (MQ=255) aaTTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcag < 1:3557459‑M1/150‑16 (MQ=255) aaTTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCTACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcag < 1:2660470‑M1/150‑16 (MQ=255) aTTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattatatgacgaaagc > 1:2164658‑M1/1‑134 (MQ=255) tttAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtt > 1:2738418‑M1/1‑133 (MQ=255) gTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAGTTGTTAAAGAGCAGTGCcgcttc > 1:787414/1‑150 (MQ=255) tttGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTATTAAAGAGCAGTGCcgcttcg < 1:3456203/150‑1 (MQ=25) tttGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTATTAAAGAGCAGTGCcgcttcg < 1:718829/150‑1 (MQ=25) 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tAAGTTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGCGCGGGGTGTGCATAATACG‑CTTTCCCGCTACAGAGTCAAGCATTTTTT‑ACTTTTCTCTGCCGGAATTCTCAGGAGAACCCCGCTGACCCGGCGGCGTGCTTGCCgtt > 1:1395274/1‑150 (MQ=255) | ATGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAGTTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGCGCGGGGTGTGCATAATACG‑CTTTCCCGCTACAGAGTCAAGCATTTTTT‑ACTTTTCTCTGCCGGAATTCTCAGGAGAACCCCGCTGACCCGGCGGCGTGCTTGCCGTTGT > Xen14_10/322‑620 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |