| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_10 | = 471 | 565 (3.010) | 394 (2.780) | 157/268 | 0.0 | 60.6% | intergenic (–/+246) | –/hemG | –/Protoporphyrinogen IX dehydrogenase [menaquinone] |
| ? | Xen14_23 | = 73961 | 0 (0.000) | intergenic (+235/–) | gmhB/– | D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose‑1,7‑bisphosphate 7‑phosphatase/– | |||||
Only 100 of 394 total aligned reads displayed.
TGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_10/323‑471‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agattgtctgataaATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGAAG < Xen14_23/73961‑73829 GATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAAT > 1:3478453/1‑150 ATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATT < 1:1009224/150‑1 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1:1128103/1‑150 TCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGC < 1:1407498/150‑1 CAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCA > 1:105112/1‑150 CAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCATAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCA > 1:3454800/1‑150 AATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAG < 1:2266191/150‑1 AATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAG < 1:3557459/150‑1 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1:4148180/150‑1 TAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTATTAAAGAGCAGTgcc < 1:4090527/150‑4 AAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCG > 1:1416871/1‑150 AAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGA > 1:1685493/1‑150 AGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGAC < 1:421454/149‑1 TTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTCAAGAGCAGTTGCGACGCGG > 1:2400350/1‑150 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GTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAG < 1:1093554/150‑1 GTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAG < 1:3594739/150‑1 CTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGA > 1:480735/1‑150 TTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTAGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGAT < 1:2548230/150‑1 GCGACGTTAAGAATACGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTT > 1:3873486/1‑150 CGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTT < 1:2420496/150‑1 ACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTC < 1:1615564/150‑1 ACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTC < 1:681387/150‑1 ACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTC < 1:1888548/150‑1 cgcTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATACTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCT < 1:19773/147‑1 gcTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTC > 1:4194083/3‑150 AGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAGATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCA < 1:734147/150‑1 GTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAAC > 1:3051162/1‑150 GTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAAC < 1:3919607/150‑1 TATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACC < 1:4135959/150‑1 CTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGC > 1:2210320/1‑150 TTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCCTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCT < 1:2083370/150‑1 GTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTG < 1:2350306/150‑1 CCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGT > 1:505268/1‑150 CAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTG < 1:2753945/141‑1 TGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_10/323‑471‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agattgtctgataaATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGAAG < Xen14_23/73961‑73829 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |