| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_168 | = 629 | 0 (0.000) | 41 (0.060) | 28/216 | 2.0 | 100% | intergenic (‑111/–) | Xen14_04774/– | IS200/IS605 family transposase IS200C/– |
| ? | Xen14_5 | 41 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+80) | –/cspE | –/Cold shock‑like protein CspE | |||||
CCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_168/524‑629‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTACGTTTGCAGCAGAAG > Xen14_5/41‑149 CCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCG > 1:2528060/1‑150 CCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCT > 1:3010450/1‑150 CCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCT > 1:3010452/1‑150 TTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATT < 1:1655726/150‑1 TTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTA < 1:3920530/150‑1 TGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAACTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑AACGCTGATTAA > 1:1463090/1‑150 TGATTTCTTGTTTGACACTTACAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAA > 1:673282/1‑150 GATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCAAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAG > 1:3375975/1‑150 TTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGG < 1:2176844/150‑1 TTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGG < 1:2176847/150‑1 TTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTG > 1:3332808/1‑150 TTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGA < 1:1921678/150‑1 TGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAA > 1:1744390/1‑150 GACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTTAATCAGCGGGTTTTtttt < 1:1785095/150‑5 GACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAAT < 1:3001298/150‑1 ACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAACCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAAT < 1:3509430/150‑1 ACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCT < 1:1419905/150‑1 TGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCATAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGC > 1:3491794/1‑150 GTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGAC < 1:3932687/150‑1 TTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACG < 1:2906066/150‑1 TGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGT > 1:2409182/1‑150 TGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGT > 1:2409183/1‑150 GCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTA > 1:932249/1‑150 GCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTA > 1:932251/1‑150 GCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTA > 1:1789504/1‑150 CGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACA > 1:2127869/1‑150 GCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTGCCGGAACCCCCAGACTAGCTGGGGGTTTTCTGTACACAAAAAAAA‑ACCGCTGCTTAAGCGGGTTTTAAATCCTTGCTGCCGTATCTTAaag > 1:4233562/1‑147 AGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAACTGGGGGTTTTCTGTGCGCAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGC < 1:2304575/150‑1 AGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAACTGGGGGTTTTCTGTGCGCAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTACCTTACAGAGC < 1:2304576/150‑1 TTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTA < 1:3254051/150‑1 TTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTA > 1:882897/1‑150 AACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑ACCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTACGTT > 1:611129/1‑150 CAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCATCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAACTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTACGTTTG < 1:439972/150‑1 ATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTACGTTTGCAG < 1:2163419/150‑1 ATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAACCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTACGTTTGCAG < 1:2862811/150‑1 CAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTACGTTTGCAGCA > 1:4096942/1‑150 AAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGTTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTACGTTTGCAGCAG > 1:482784/1‑150 AAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTACGTTTGCAGCAG > 1:1718114/1‑150 AAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTACGTTTGCAGCAG > 1:1718113/1‑150 AGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGTTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTACGTTTGCAGCAGAAG < 1:1907991/150‑1 AGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTACGTTTGCAGCAGAAG < 1:1907990/150‑1 CCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_168/524‑629‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAA‑CCCGCTGATTAAGCGGGTTTTGAATTCTTGCTGACGTATCTTACAGAGCGATTACGTTTGCAGCAGAAG > Xen14_5/41‑149 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |