| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | Xen14_1 | = 242479 | 1286 (17.050) | 344 (4.230) | 102/286 | 0.0 | 21.7% | coding (67/375 nt) | Xen14_00217 | IS3 family transposase ISLad1 |
| ? | Xen14_186 | 394 = | NA (NA) | intergenic (‑103/–) | Xen14_04784/– | IS3 family transposase ISCfr6/– | |||||
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
ACCACCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_1/242331‑242479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccctgGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_186/394‑465 CCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGC < 1:3354155/150‑1 GGCATCCATTCGTTCTTCAGATTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTATCCTGGACGCCC > 1:2828411/1‑150 TCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCT < 1:1016907/150‑1 CATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAA > 1:2165802/1‑150 CATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAA > 1:481120/1‑150 CATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAA > 1:1768699/1‑150 CATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGCATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCACTCCTAA > 1:481111/1‑150 ATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAG < 1:3099535/150‑1 TTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGA < 1:3784568/150‑1 TCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAG < 1:2591415/150‑1 TCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAG < 1:2656285/150‑1 TCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAG < 1:3905747/150‑1 TCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAG < 1:3559599/150‑1 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1:3333387/150‑1 TTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACCGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAAT > 1:3552237/1‑150 TCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATG < 1:848772/150‑1 TCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATG < 1:546692/150‑1 CCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCAACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTCTCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGT > 1:2853338/1‑150 CGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTA < 1:2341094/150‑1 GCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAT < 1:3157500/150‑1 CCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaa > 1:3110503/1‑147 CGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaac < 1:202352/150‑5 CTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttc > 1:514593/1‑143 CTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCATGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttc > 1:3028334/1‑143 TCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCCTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcg > 1:2397051/1‑142 TCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCATATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcg > 1:2333756/1‑142 ATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcg > 1:1367356/1‑140 TACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATGATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGACGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgt < 1:2676266/150‑12 ACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtg > 1:1961800/1‑138 CTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAGTGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtga > 1:1036669/1‑137 CTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTAATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtga < 1:2064178/150‑14 CTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATAACTACCCTGGACGCCCTTCTCAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTTCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacctcgcgtga > 1:4111495/1‑137 TCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtgag < 1:2120086/150‑15 TCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtgag < 1:818149/150‑15 ACCACCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_1/242331‑242479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccctgGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_186/394‑465 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |