| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_134 | 693 = | 70 (0.700) | 38 (0.340) | 29/296 | 1.9 | 35.2% | intergenic (–/+154) | –/Xen14_04742 | –/tRNA‑Arg(tct) |
| ? | Xen14_90 | = 74 | NA (NA) | coding (1/747 nt) | yafV | Omega‑amidase YafV | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTTCGTCGCTAGC > Xen14_90/1‑222 | aaagcgtatcgccaatACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTg < 1:2079138/135‑1 (MQ=25) atataatggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTgg > 1:3365913/14‑150 (MQ=255) atataatggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTgg > 1:2936489/14‑150 (MQ=255) atataatggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTgg > 1:4218268/14‑150 (MQ=255) ataatggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGaa > 1:2135711/12‑150 (MQ=255) ataatggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACCTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGaa > 1:1123010/12‑150 (MQ=21) ataatggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACCTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGaa > 1:378354/12‑150 (MQ=21) ctggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGCTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGt > 1:1327524/9‑150 (MQ=255) atggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGt > 1:2186035/9‑150 (MQ=255) tggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCAtttt > 1:726151/8‑131 (MQ=255) tggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAAACACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAgtta > 1:3910946/8‑147 (MQ=255) gggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTAc < 1:372267/147‑1 (MQ=255) ggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTAcc < 1:2607635/148‑1 (MQ=255) cccccAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCCACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTAACGGgcg > 1:3389446/1‑150 (MQ=255) 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tCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACTACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCgg < 1:3104699/150‑1 (MQ=255) tCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGAATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGACGCGATGTGATCGTTCTACCgg < 1:2639897/150‑1 (MQ=255) cGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGga > 1:3155911/1‑150 (MQ=255) gATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGgag > 1:2891323/1‑150 (MQ=255) aTACTGGAAAAACTCTACCGCGTTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATTGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGgaga < 1:267278/150‑1 (MQ=255) 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tgACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGATCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtc > 1:444360/1‑150 (MQ=255) tgACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGATCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtc > 1:1723192/1‑150 (MQ=255) gACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTCCCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcg > 1:4206255/1‑150 (MQ=255) gACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcg > 1:803228/1‑150 (MQ=255) aCCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcgt < 1:910648/150‑1 (MQ=255) ccACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTATCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcgtc > 1:2724665/1‑150 (MQ=255) ccACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcgtc < 1:3267648/150‑1 (MQ=255) cACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTGGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcgtcg < 1:3807164/150‑1 (MQ=255) aCTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTTCGTCGc > 1:3642000/1‑150 (MQ=255) ccgcATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTTATCGTCAACTGTAAGGTAGTACCGGGCGCGATGGGATCGTGCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTTCGTCGCt < 1:4043434/147‑1 (MQ=255) tCATGCAGCAACCGCTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTTCGTCGCTAg > 1:2724465/1‑150 (MQ=255) tCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTTCGTCGCTAg < 1:2005062/150‑1 (MQ=255) cATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTTCGTCGCTAGc < 1:1815070/150‑1 (MQ=255) cATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTTCGTCGCTAGc < 1:1815071/150‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTTCGTCGCTAGC > Xen14_90/1‑222 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |