| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_134 | 693 = | 70 (0.700) | 38 (0.340) | 29/296 | 1.9 | 35.2% | intergenic (–/+154) | –/Xen14_04742 | –/tRNA‑Arg(tct) |
| ? | Xen14_90 | = 74 | NA (NA) | coding (1/747 nt) | yafV | Omega‑amidase YafV | |||||
TTCTTCCAGATTTCTTCCGGCAGAGCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_134/840‑693‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCCGATTCGTTTGGGGGTAA‑‑‑ < Xen14_90/74‑1 tcCTTCCAGATTCCTTCCGGCAGAGCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTG < 1:4375997/148‑1tcCTTCCAGATTCCTTCCGGCAGAGCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTG < 1:3171484/148‑1 TTCCAGATTCCTTCCGGCAGAGCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAG > 1:4205521/1‑150 TTCCAGATTCCTTCCGGCAGAGCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAG < 1:3114214/150‑1 AGATTCCTTCCGGCAGAGCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGT < 1:692974/150‑1 tcCTTCCGGCAGAGCCTTATACTAGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAgc < 1:663271/148‑3 cCTTCCGGCAGAGCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACA > 1:3779450/2‑150 CTTCCGGCAGAGCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAA > 1:3360648/1‑150 TCCGGCAGAGCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAA < 1:808900/150‑1 GCAGAGCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTG < 1:855258/150‑1 agatCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGC < 1:3055203/146‑1 GAGCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCC < 1:2456939/150‑1 CCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGATTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACC > 1:3032118/1‑150 CTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGCCAACAAAAAC < 1:1811099/141‑1 AATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTT > 1:3535044/1‑150 TATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTT < 1:582837/150‑1 TATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTT < 1:582836/150‑1 TACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTC > 1:1310730/1‑150 CCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCA > 1:2168791/1‑150 CCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCA > 1:3436697/1‑150 GGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTA < 1:91767/150‑1 GGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACACAAACTGGCCAACGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGctt > 1:4033866/1‑147 ATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTT < 1:2230083/150‑1 ATATTGTCGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTT < 1:2691216/150‑1 ATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCC < 1:965330/150‑1 ATTGTTGAAAATATTATATGTTGGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCC < 1:965331/150‑1 GTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCCGAT < 1:3019947/150‑1 TGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTAGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCCGATTC > 1:2855111/1‑150 AAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCCGATTCGT > 1:2031574/1‑150 AATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCCGATTCGTTT < 1:3158183/150‑1 ATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCATCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCCGATTCGTTTGGG < 1:352666/150‑1 TTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCCGATTCGTTTGGGG < 1:621555/150‑1 TATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCCGATTCGTTTGGGGGTA > 1:4122277/1‑150 TGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGCTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCA > 1:1406142/1‑100 GTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCCGATTCGTTTGGGGGTAAcc < 1:3272792/150‑3 GTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCCGATTCGTTTGGGGGTAAcc > 1:2999232/1‑148 TTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTTGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGT < 1:682985/110‑1 TTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATTCGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCCGATTCGTTTGGGGGTAAtcc < 1:2633776/150‑4 TTCTTCCAGATTTCTTCCGGCAGAGCCTTATACTGGAATATACCTGGCTCAGGATATTGTTGAAAATATTATATGTTTGTCAAAAATAAAAGTTCTGTTAAGTATTGATTGAGTGTTTGTTATACGGTCTAATGGTTTTTTCAGTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_134/840‑693‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAAGTGGTCAACAAAAACTGGCCACCGCGTTAGAGTTTTTCCAGTATCGATTTTCCGATTCGTTTGGGGGTAA‑‑‑ < Xen14_90/74‑1 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |