| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_124 | 1 = | 0 (0.000) | 89 (0.660) +A |
61/294 | 0.9 | 100% | intergenic (–/‑29) | –/Xen14_04720 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_165 | = 691 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
ATTGTGACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_165/543‑691 | aTTGTGACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGt < 1:4127884‑M2/150‑2 (MQ=255) ttGTGACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTTTTTATACGCCGca < 1:1693044‑M2/150‑3 (MQ=255) gACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCACGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattcc < 1:2271200‑M2/150‑7 (MQ=255) cTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccac > 1:322734‑M2/1‑142 (MQ=255) cATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattc > 1:2059247‑M2/1‑140 (MQ=255) cATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattc < 1:2300428‑M2/150‑11 (MQ=255) aTCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattct < 1:619877‑M2/150‑12 (MQ=255) aTCTTCATGATGGTAGCGGTAGTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTGTGTGGTTTCTTAATCTGATTTCTGGTGATGTTGTTTTGCCCAGGATGGTTTCAGCCAGGTTTACGTGTTTCTTTATACGCCGcattccattct > 1:3055762‑M2/1‑139 (MQ=255) cTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattcttt < 1:335487‑M2/150‑14 (MQ=255) ttCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattcttta > 1:3382129‑M2/1‑136 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAACCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATGCGCCGcattccattctttaa > 1:3471862‑M2/1‑135 (MQ=255) ccTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCNGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaat < 1:3742690‑M2/150‑17 (MQ=255) ccTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaat > 1:3997752‑M2/1‑134 (MQ=255) cTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaatt > 1:284790‑M2/1‑133 (MQ=255) cTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaatt > 1:284785‑M2/1‑133 (MQ=255) cTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaatt > 1:284789‑M2/1‑133 (MQ=255) tGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaatta < 1:245989‑M2/150‑19 (MQ=255) tGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaatta < 1:245986‑M2/150‑19 (MQ=255) tGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaaga < 1:3633685‑M2/150‑22 (MQ=255) tGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaaga > 1:3107991‑M2/1‑129 (MQ=255) ggTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaagag > 1:2984798‑M2/1‑128 (MQ=255) tAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattccttaattaagaggg < 1:1484213‑M2/150‑25 (MQ=255) aGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaagag > 1:2979480‑M2/1‑125 (MQ=255) tATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaattaagagggtgattt < 1:10609‑M2/150‑31 (MQ=255) aTTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaattaagagggtgattta > 1:2206361‑M2/1‑119 (MQ=255) aTTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccat > 1:2690798‑M2/1‑119 (MQ=255) cctttctttgtgcagagttgccttcTTTTGTTTTGTGGTTTCTTAATCGGATTTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaattaagagggtgatttatggc > 1:3859966‑M2/13‑115 (MQ=255) ccTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaattaagagggtgatttatggc > 1:3765313‑M2/1‑115 (MQ=255) ccTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaattaagagggtgatttatggc > 1:8998‑M2/1‑115 (MQ=255) ccTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaagagggtgatttatggc > 1:676735‑M2/1‑115 (MQ=255) cTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCTGtattccattctttaattaagagggtgatttatggct < 1:1100800‑M2/150‑37 (MQ=255) cGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaagagggtgatttatggctat > 1:1059183‑M2/1‑112 (MQ=255) ttttttCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattcttt < 1:1448441‑M2/122‑14 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |