| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_124 | 1 = | 0 (0.000) | 89 (0.660) +A |
61/294 | 0.9 | 100% | intergenic (–/‑29) | –/Xen14_04720 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_165 | = 691 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTGCCGGGTTCTGGCAAATCTTATGAAGTGGTTAAGTCTGTTATTATTCCGGCTGTTGCATCCGGCCGAAGGATTGTCTCAAATATATACGGACT > Xen14_124/1‑148 | ttgtgactcatcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttttttatacgccgca < 1:1693044‑M1/1‑1 (MQ=255) tgtgactcatcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtAt < 1:3178530‑M1/2‑1 (MQ=255) tgactcatcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTc > 1:2935112‑M1/147‑150 (MQ=255) gactcatcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcattcc < 1:3687772‑M1/5‑1 (MQ=255) gactcatcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccacgtttacgcgtttctttatacgccgtATTcc < 1:2271200‑M1/5‑1 (MQ=255) ctcatcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCAt < 1:3470220‑M1/7‑1 (MQ=255) catcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTc > 1:2059247‑M1/142‑150 (MQ=255) catcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTc < 1:2300428‑M1/9‑1 (MQ=255) atcttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCt < 1:619877‑M1/10‑1 (MQ=255) cttcctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCttt < 1:387852‑M1/12‑1 (MQ=255) cctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcngccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTttaat < 1:3742687‑M1/15‑1 (MQ=255) cctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcngccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTttaat < 1:3742690‑M1/15‑1 (MQ=255) cctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTttaat > 1:3997752‑M1/136‑150 (MQ=255) ctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTttaatt > 1:284789‑M1/135‑150 (MQ=255) ctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTttaatt > 1:284786‑M1/135‑150 (MQ=255) ctgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcctctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgctgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtCTTCCATTCTttaatt < 1:2889770‑M1/16‑1 (MQ=255) tgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTttaatta < 1:245989‑M1/17‑1 (MQ=255) tgatggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTttaatta < 1:245986‑M1/17‑1 (MQ=255) atggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAag < 1:3417898‑M1/19‑1 (MQ=255) tggtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAaga > 1:3107991‑M1/131‑150 (MQ=255) gtagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAgg < 1:3985979‑M1/22‑1 (MQ=255) tagcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCCTTAATTAAGAggg < 1:1484213‑M1/23‑1 (MQ=255) agcagtatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAagag > 1:2979480‑M1/127‑147 (MQ=255) tatttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGAttt < 1:10609‑M1/29‑1 (MQ=255) atttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCAt > 1:2690798‑M1/121‑127 (MQ=255) atttcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTa > 1:2206361‑M1/121‑150 (MQ=255) tcctcgcttttttcagatttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATgg > 1:4062347‑M1/118‑150 (MQ=255) tcctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATgg > 1:3251967‑M1/118‑150 (MQ=255) cctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGc > 1:8998‑M1/117‑150 (MQ=255) cctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGc > 1:676735‑M1/117‑150 (MQ=255) cctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGc > 1:3826391‑M1/117‑150 (MQ=255) ctcgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgctgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCt < 1:1100800‑M1/35‑1 (MQ=255) cgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTAt > 1:2988250‑M1/114‑150 (MQ=255) cgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTAt > 1:3784408‑M1/114‑150 (MQ=255) cgcttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTAt > 1:1059183‑M1/114‑150 (MQ=255) cttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGCTTTATGGCTATTa < 1:3570330‑M1/39‑1 (MQ=255) cttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTa < 1:3054052‑M1/39‑1 (MQ=255) cttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTa < 1:3517172‑M1/39‑1 (MQ=255) ttttttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCttt < 1:1448441‑M1/12‑1 (MQ=255) tttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTttaattaa < 1:1647467‑M1/18‑1 (MQ=255) tttcagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGc < 1:3261376‑M1/43‑1 (MQ=255) cagagttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTAc > 1:2536273‑M1/105‑144 (MQ=255) gttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATAtt < 1:872429‑M1/50‑1 (MQ=255) gttgccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATAtt < 1:872436‑M1/50‑1 (MQ=255) gccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGc > 1:1610306‑M1/98‑150 (MQ=255) ccttcttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCg > 1:853765‑M1/97‑150 (MQ=255) ttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTGCCg < 1:1999690‑M1/59‑1 (MQ=255) ttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTGCCg > 1:4426692‑M1/92‑150 (MQ=255) ttctgttttgtggtttcttaatctgatgtcttttgatgttgttttgcccatgatggtttcagccatgtttacgcgtttctttatacgccgcATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTGCCg < 1:1368533‑M1/59‑1 (MQ=255) 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gtATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTGCAGGGTTCTGGCAAATCTTATGAAGTGGTTAAGTCTGTTATTATTCCGGCTGTTGCATCCGGCCGAAGGATTGTCTCAAata < 1:2119264‑M1/138‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTCCATTCTTTAATTAAGAGGGTGATTTATGGCTATTACTGCATATATTGGCGTGCCGGGTTCTGGCAAATCTTATGAAGTGGTTAAGTCTGTTATTATTCCGGCTGTTGCATCCGGCCGAAGGATTGTCTCAAATATATACGGACT > Xen14_124/1‑148 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |