| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | Xen14_1 | 242480 = | NA (NA) | 389 (2.930) | 119/296 | 0.0 | 74.7% | coding (66/375 nt) | Xen14_00217 | IS3 family transposase ISLad1 |
| ? | Xen14_105 | 4697 = | 132 (0.750) | coding (418/480 nt) | Xen14_04638 | IS3 family transposase ISCfr6 | |||||
Only 100 of 522 total aligned reads displayed.
GCTATCTGGCGGTTGTGATGGATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGGA > Xen14_105/4548‑4846 | tgtgATGGATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCgg < 1:3405177/150‑1 (MQ=255) tgATGGATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTa > 1:962002/1‑150 (MQ=255) tttGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTat < 1:2344261/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCACAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTatc < 1:945053/150‑1 (MQ=255) ccGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTAtcatca > 1:2072292/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTAtcatca > 1:3440982/1‑150 (MQ=255) tGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGAc > 1:2510620/1‑150 (MQ=255) cgttctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTgg > 1:1579847‑M2/93‑150 (MQ=255) gttctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGgt > 1:919097‑M2/92‑150 (MQ=255) tctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGgtgt < 1:3922200‑M2/61‑1 (MQ=255) tctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGgtgt > 1:3056439‑M2/90‑150 (MQ=255) tctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGgtgt < 1:2602987‑M2/61‑1 (MQ=255) tctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGgtgt < 1:4063822‑M2/61‑1 (MQ=255) ctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGtgtg < 1:3523136‑M2/62‑1 (MQ=255) ctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGtgtg < 1:790493‑M2/62‑1 (MQ=255) tGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGAtt > 1:3676154/1‑150 (MQ=255) gccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGAtt < 1:2948950‑M2/65‑1 (MQ=255) ccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTa > 1:2415296‑M2/85‑150 (MQ=255) 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ccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATCACTGATGCAGTGAAGAc > 1:2295161‑M2/69‑150 (MQ=255) catgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTg < 1:3716702‑M2/77‑1 (MQ=255) catgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGAcc < 1:4086920‑M2/83‑1 (MQ=255) gCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCtt > 1:1226309/1‑150 (MQ=255) aaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTcc > 1:3571465‑M2/64‑150 (MQ=255) 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acccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTtgtg > 1:2693322‑M2/29‑150 (MQ=255) aCCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTtgtg > 1:3935132/1‑150 (MQ=255) cggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTcc < 1:893258‑M2/125‑1 (MQ=255) acaTGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTcc < 1:3968947/150‑1 (MQ=255) cggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGc < 1:4356906‑M2/128‑1 (MQ=255) gggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGccc < 1:523460‑M2/130‑1 (MQ=255) gggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATACAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGccc > 1:1960836‑M2/21‑150 (MQ=255) ggtgatgttccacagcgatGGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCt < 1:2781943‑M2/131‑1 (MQ=255) atgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCcctgtac < 1:2820182‑M2/135‑4 (MQ=255) atgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGAc < 1:1491798‑M2/135‑1 (MQ=255) 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gttCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCTGCATCCCGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCt > 1:1110848/1‑150 (MQ=255) ttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTg > 1:4017843‑M2/13‑150 (MQ=255) ccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTc > 1:3335426‑M2/11‑150 (MQ=255) cacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCg > 1:3794427‑M2/10‑150 (MQ=255) cATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCg < 1:384656/150‑1 (MQ=255) acagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCgg < 1:3558195‑M2/142‑1 (MQ=255) cagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACt > 1:732911‑M2/8‑106 (MQ=255) gCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTg > 1:1446618/1‑150 (MQ=255) cgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAATACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGc < 1:2117238‑M2/146‑1 (MQ=255) gatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGGTCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGATCTGTCGGTTGcc < 1:4197467‑M2/147‑1 (MQ=255) atAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCg < 1:2550106‑M2/148‑1 (MQ=255) tAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCgg > 1:819896‑M2/2‑150 (MQ=255) | GCTATCTGGCGGTTGTGATGGATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGGA > Xen14_105/4548‑4846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |