| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | Xen14_1 | 242480 = | NA (NA) | 389 (2.930) | 119/296 | 0.0 | 74.7% | coding (66/375 nt) | Xen14_00217 | IS3 family transposase ISLad1 |
| ? | Xen14_105 | 4697 = | 132 (0.750) | coding (418/480 nt) | Xen14_04638 | IS3 family transposase ISCfr6 | |||||
Only 100 of 389 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_1/242556‑242480‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGG > Xen14_105/4697‑4845 gttctcgccggacaGCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGT < 1:685494/136‑1 tctcgccggacaGCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGT < 1:2602987/138‑1 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CGGGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGC < 1:1448127/150‑1 GGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCC < 1:408979/150‑1 GGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATACAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCC > 1:1960836/1‑150 GATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGA < 1:3226866/150‑1 ATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGAC > 1:2412249/1‑150 TGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACC < 1:904058/150‑1 TGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTGAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACC < 1:3541768/150‑1 GTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCT > 1:2971494/1‑150 CCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTC < 1:12963/150‑1 CCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTC > 1:3335426/1‑150 ACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGG < 1:3663015/150‑1 ACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGG < 1:1281189/150‑1 ACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGG < 1:3906037/150‑1 CAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACT > 1:732911/1‑106 AGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTT < 1:2209219/150‑1 GCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGCTTACTGATGCCGTAAAGAACTTCCCGCATCCTGCCTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTG > 1:3794889/1‑150 CGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTGGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTTAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTTTGTCCTGCCCTGGACCTGTTGGTTGC < 1:3926879/150‑1 ATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCG < 1:3486244/150‑1 TAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGG > 1:819896/1‑150 TAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGAC < 1:1124889/136‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_1/242556‑242480‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGG > Xen14_105/4697‑4845 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |