| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_1 | = 242479 | 1279 (14.250) | 303 (3.400) | 102/286 | 0.0 | 19.7% | coding (67/375 nt) | Xen14_00217 | IS3 family transposase ISLad1 |
| ? | Xen14_186 | 394 = | NA (NA) | intergenic (‑103/–) | Xen14_04784/– | IS3 family transposase ISCfr6/– | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCGCTGGCACCCATTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_186/246‑465 | tCGCTGGCACCCATTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGa > 1:3275679/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCACCCATTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGAc < 1:4056922/150‑1 (MQ=255) gCTGGCACCCATTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACg < 1:2626883/150‑1 (MQ=255) gCTGGCACCCATTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACg < 1:3883457/150‑1 (MQ=255) gCACCCATTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCt < 1:1084294/150‑1 (MQ=255) gCACCCATTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCt < 1:1549952/150‑1 (MQ=255) cACCCATTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCtt > 1:478742/1‑150 (MQ=255) cACCCATTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCtt > 1:439005/1‑150 (MQ=255) aTTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAag < 1:764951/150‑1 (MQ=255) aTTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAag < 1:764953/150‑1 (MQ=255) aTTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAag < 1:764955/150‑1 (MQ=255) ttCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAaga < 1:1439975/150‑1 (MQ=255) ttCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAaga < 1:1439980/150‑1 (MQ=255) ttCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAaga < 1:1439974/150‑1 (MQ=255) tCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAagag > 1:1689342/1‑150 (MQ=255) cTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGt < 1:1650935/150‑1 (MQ=255) tttCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAg > 1:975980/1‑150 (MQ=255) tCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGcc < 1:2047310/150‑1 (MQ=255) gACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGtt > 1:2367987/1‑150 (MQ=255) 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aagaagCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGAt < 1:1742461/150‑1 (MQ=255) aagaagCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGAt < 1:1748232/150‑1 (MQ=255) agaagCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAGCGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATg < 1:3795060/150‑1 (MQ=255) agaagCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAGCGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATg < 1:3795905/150‑1 (MQ=255) gCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGt < 1:3344203/150‑1 (MQ=255) cGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCGAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGtt < 1:926752/150‑1 (MQ=255) cGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCGAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGtt < 1:926753/150‑1 (MQ=255) cGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCGAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGtt < 1:926754/150‑1 (MQ=255) gTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTg > 1:3258185/1‑150 (MQ=255) gTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTg > 1:3258186/1‑150 (MQ=255) 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ttCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGa < 1:15911/150‑1 (MQ=255) ccATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATc < 1:2760680/150‑1 (MQ=255) ccATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATc > 1:2756801/1‑150 (MQ=255) ccATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATc < 1:3805469/150‑1 (MQ=255) cATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCt < 1:2413632/150‑1 (MQ=255) 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tGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGcc < 1:2207473/150‑1 (MQ=255) tGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCGGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGcc < 1:4128123/150‑1 (MQ=255) ggCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTg > 1:3810700/1‑150 (MQ=255) gCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGt > 1:2121138/1‑150 (MQ=255) cTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGtt < 1:4114567/150‑1 (MQ=255) tattatCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGttt > 1:3736067/1‑150 (MQ=255) attatCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGtttt < 1:1704279/150‑1 (MQ=255) atCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGAt < 1:170272/150‑1 (MQ=255) atCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGAt < 1:853818/150‑1 (MQ=255) atCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGAt < 1:1133370/150‑1 (MQ=255) 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ccgACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAtaaa < 1:1804064/150‑4 (MQ=255) cgACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAtaaac < 1:3830639/150‑5 (MQ=255) cTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAtaaacttc > 1:4078518/1‑143 (MQ=255) gACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAtaaacttcgc > 1:307695/1‑141 (MQ=255) acTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTANGAGTCAAGCCGTTNTCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAtaaacttcgcgtg > 1:3757160/1‑138 (MQ=255) acTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAtaaacttcgcgtg > 1:3687865/1‑138 (MQ=255) | TCGCTGGCACCCATTCTGTTTTCAGACTGCGGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTATTATCCCAGCAGTTTCCCCGCCGACTGACACTTTGCTTTATTCTGTAACGCCAGAGAATTTGTTGATATTTCAGGCCTGTATACTGGCTTCCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_186/246‑465 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |