| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_1 | = 242479 | 1279 (14.250) | 303 (3.400) | 102/286 | 0.0 | 19.7% | coding (67/375 nt) | Xen14_00217 | IS3 family transposase ISLad1 |
| ? | Xen14_186 | 394 = | NA (NA) | intergenic (‑103/–) | Xen14_04784/– | IS3 family transposase ISCfr6/– | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
CCACCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_1/242332‑242479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccctgGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_186/394‑465 CACCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGAC > 1:2967154/1‑150 ACCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACG < 1:1923551/150‑1 CCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGC > 1:3415046/1‑150 CCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGATGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGC > 1:3254603/1‑150 GCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCT < 1:2635624/150‑1 GCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCT < 1:1218920/150‑1 GCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCT < 1:2679965/150‑1 GCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCT < 1:2802479/150‑1 ATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTC > 1:2650229/1‑150 CCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTACAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTA < 1:3883736/150‑1 ATTCGTTCTTCATACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTTTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAG < 1:3727262/150‑1 ATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAG > 1:230604/1‑150 ATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAG > 1:230608/1‑150 ATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAG > 1:1493030/1‑150 ATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCATTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCAAAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAG > 1:3758578/1‑150 TTCGTTCTTCAGACTCCTTAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGA < 1:3223717/150‑1 TTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGATTCA < 1:4072044/150‑1 TTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCA > 1:588482/1‑150 TCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAA < 1:645916/150‑1 CTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAG > 1:3794608/1‑150 CTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAG > 1:2485649/1‑150 CTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAG < 1:2512446/150‑1 TCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCC > 1:720860/1‑150 TCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCC < 1:4250090/150‑1 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1:2569577/1‑150 CCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCG > 1:2059573/1‑150 AAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGAT > 1:3290034/1‑150 GAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGC > 1:2943534/1‑150 GAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGC < 1:2013700/150‑1 CGTTCTATTGGGCTGTTGTCCCAGCAGTTTCCGCGCCCGCTCATACTCTACGTGATCCGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCTTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTT < 1:3975473/150‑1 CGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTT > 1:955782/1‑150 GTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTG < 1:1180394/150‑1 GTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTG < 1:1248857/150‑1 GTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTACCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTG > 1:2972051/1‑150 GTTCCACTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTACTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTACGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTG > 1:485510/1‑150 TTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGA > 1:3515896/1‑150 TTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGA < 1:3693592/150‑1 TTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGA > 1:2877568/1‑150 TCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGAT > 1:2311151/1‑150 TCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGAT < 1:876943/150‑1 CCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATC < 1:447615/150‑1 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1:1365185/1‑150 TGGGCTGTTATCCCAGCGGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCC < 1:3924402/150‑1 TGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGtc < 1:522857/150‑3 TGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCC < 1:1155346/150‑1 GGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTG > 1:2372749/1‑150 GGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAG < 1:3632922/116‑1 GCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGT > 1:2402383/1‑150 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GCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCGAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAAGGTAT < 1:3427815/150‑1 CGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATa < 1:799574/150‑2 GCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaa > 1:3053905/1‑148 CGGCTCATACTCTGTGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTGGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaac < 1:2774381/150‑5 CGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaac < 1:1015325/150‑5 GGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAGTAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaact < 1:1127668/150‑6 GGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaact > 1:746153/1‑145 CTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttc > 1:677046/1‑143 CTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttc > 1:1117988/1‑143 CTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttc > 1:928588/1‑143 CTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTCGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttc > 1:2395008/1‑143 CTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCACCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGAT < 1:1711820/128‑1 ATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcg < 1:1075197/150‑11 TCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtgag < 1:358053/150‑15 TCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtgag < 1:1656575/150‑15 TCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtgag > 1:1048058/1‑136 CTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGTAGTAATGTATaaacttcgcgtgaga < 1:2497114/150‑16 CTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtgaga < 1:3942467/150‑16 TGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGAT < 1:830536/110‑1 CACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTA < 1:2102245/103‑1 CCACCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_1/242332‑242479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccctgGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_186/394‑465 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |