| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_168 | = 629 | 0 (0.000) | 19 (0.040) | 12/172 | 2.1 | 100% | intergenic (‑111/–) | Xen14_04774/– | IS200/IS605 family transposase IS200C/– |
| ? | Xen14_2 | 63 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+66) | –/ydgJ | –/putative oxidoreductase YdgJ | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCAGCTCAATCAACTCCATTACCTGGATTGCCTG > Xen14_2/1‑206 | ccttttgatttcttgtttgacacttgcagttgccagaccgcaatgtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGc < 1:119298‑M2/47‑1 (MQ=255) tttcttgtttgacacttgcagttgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCa > 1:1816862‑M2/96‑150 (MQ=255) tttcttgtttgacacttgcagttgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCa > 1:1816865‑M2/96‑150 (MQ=255) tttcttgtttgacacttgcagttgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCa > 1:1816866‑M2/96‑150 (MQ=255) tttcttgtttgacacttgcagttgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCa > 1:1816868‑M2/96‑150 (MQ=255) ttcttgtttgacacttgcagttgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGc > 1:3975957‑M2/95‑141 (MQ=255) tcttgtttgacacttgcagttgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGTCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCAcc > 1:528840‑M2/94‑150 (MQ=255) tcttgtttgacacttgcagttgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGTCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCAcc > 1:528837‑M2/94‑150 (MQ=255) gtttgacacttgcagttgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggcgcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATcc > 1:3869634‑M2/90‑150 (MQ=255) acttgcagttgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcagaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTc > 1:2476928‑M2/83‑150 (MQ=255) cagttgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCa < 1:2063097‑M2/73‑1 (MQ=255) agttgccagaccgcaaggtgtattaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCATCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCaa > 1:550592‑M2/77‑150 (MQ=255) agttgccagaccgcaaggtgtattaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCATCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCaa > 1:550589‑M2/77‑150 (MQ=255) gttgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAg > 1:2389617‑M2/76‑150 (MQ=255) gttgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAg > 1:2389620‑M2/76‑150 (MQ=255) tgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACCAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGc > 1:3612666‑M2/74‑150 (MQ=255) tgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGc < 1:3640900‑M2/77‑1 (MQ=255) tgccagaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTCTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGc > 1:3822084‑M2/74‑150 (MQ=255) agaccgcaaggtgttttaacaaatcaaaaggggttttaataactggcccaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAACATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACaa > 1:351541‑M2/70‑150 (MQ=255) aaGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTcgcg < 1:434932/150‑1 (MQ=255) tgtTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGAt > 1:1863348/1‑150 (MQ=255) gtTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCa < 1:3674229/126‑1 (MQ=255) tttAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGtt > 1:154906/1‑150 (MQ=255) tttAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGtt > 1:1752026/1‑150 (MQ=255) tttAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGtt > 1:1752027/1‑150 (MQ=255) tttAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGtt > 1:1426267/1‑150 (MQ=255) ttAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGttt > 1:282448/1‑150 (MQ=255) ttAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGttt > 1:282451/1‑150 (MQ=255) aaCAAATCAAAAGGGTTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTgg < 1:2009403/150‑1 (MQ=255) aCAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCATCATCCCCTTTTCACGCGAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGc > 1:1020589/1‑150 (MQ=255) cAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCg > 1:1515689/1‑150 (MQ=255) aaTCAAAAGGGGTTTTAATAACTTGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGa > 1:3240889/1‑150 (MQ=255) gTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCa > 1:3585742/1‑150 (MQ=255) taaCTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACaaa < 1:4323207/112‑1 (MQ=255) aaCTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCAGCtcaatc < 1:3072707/150‑1 (MQ=255) cTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATg < 1:3977392/120‑1 (MQ=255) cTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCAGCtcaatcaa > 1:2715179/1‑150 (MQ=255) tGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCATAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCAGCTCAATCAAc < 1:3909275/150‑1 (MQ=255) cTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCAGCTCAATCAACTCCATTACCt > 1:2280789/1‑150 (MQ=255) cTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCAGCTCAATCAACTCCATTACCt > 1:2076583/1‑150 (MQ=255) gCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCAGCTCAATCAACTCCATTACCTGGATTg > 1:2687777/1‑150 (MQ=255) gCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCAGCTCAATCAACTCCATTACCTGGATTg > 1:2687776/1‑150 (MQ=255) ttCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCAGCTCAATCAACTCCATTACCTGGATTGCCt > 1:3023233/1‑150 (MQ=255) tCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAGAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCAGCTCAATCAACTCCATTACCTGGATTGCCTg < 1:4023828/150‑1 (MQ=255) cagaaaaCCCCCAGC‑TAGGCTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCAGCTCAATCAACTCCATTACCTGGATTGCCTg > 1:1545559/6‑150 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAATGGATGGTGCTAATTGCACCATCCCCTTTTCACGCAAGGCACAAAGTCGCGCGATGTTTGGCGGATTCGATGCCCAGCTCAATCAACTCCATTACCTGGATTGCCTG > Xen14_2/1‑206 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |