| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Xen14_17 | = 79810 | 326 (2.190) | coding (460/741 nt) | Xen14_02064 | IS4 family transposase ISEc13 | |||||
Only 100 of 4505 total aligned reads displayed.
CGCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGTAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATAACCACCATGCGCTCAAGGTTATCCCGGGTCTGCATTCGCAGCGATTCCACACATGTACCACCACTTTTCCACGCTTTGTGGTATTCCTCTATCAGCCAGCGTTGCTCGTAATGGCTGACGATAC > Xen14_17/79661‑79959 | cGCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTTATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCg > 1:1498504/1‑150 (MQ=255) gCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGc > 1:2925640/1‑150 (MQ=255) ccAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCa < 1:138423/150‑1 (MQ=255) cAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTATCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAg > 1:931464/1‑150 (MQ=255) aGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAgg < 1:4187753/150‑1 (MQ=255) aGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCATCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAgg < 1:2852356/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGc > 1:2584789/1‑150 (MQ=255) tttCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGcc < 1:522508/150‑1 (MQ=255) tttCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGGATTTTCGCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGcc < 1:4440195/150‑1 (MQ=39) ttCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGccc > 1:2339162/1‑150 (MQ=255) tcaaaCAGGCCCATTTCAGGGTCGGTGTTTGCGCCGGAAGCTGCTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGTAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCa < 1:1182779/146‑1 (MQ=255) tCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCa < 1:1869007/150‑1 (MQ=255) cAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAg < 1:331275/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |