| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | Xen14_166 | = 685 | 0 (0.000) | 3228 (2.800) | 234/244 | -0.0 | 95.2% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_17 | = 79810 | 326 (2.190) | coding (460/741 nt) | Xen14_02064 | IS4 family transposase ISEc13 | |||||
Only 100 of 3245 total aligned reads displayed.
CATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_166/536‑685 | ttACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAGGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcg > 1:3672758‑M1/1‑148 (MQ=255) tACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcgg > 1:1109827‑M1/1‑147 (MQ=255) gAGCGATGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcag < 1:2717074‑M1/150‑7 (MQ=255) gAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcag < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |