| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_124 | = 2576 | 0 (0.000) | 47 (0.620) +CCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACA |
33/240 | 0.4 | 100% | intergenic (+232/–) | sctC_2/– | Type 3 secretion system secretin/– |
| ? | Xen14_21 | 74761 = | NA (NA) | intergenic (+146/–) | hipA/– | Serine/threonine‑protein kinase toxin HipA/– | |||||
AGCAGGAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_124/2432‑2576 | agcagGAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTgg < 1:782331/145‑1 (MQ=255)agcagGAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTgg < 1:782328/145‑1 (MQ=255)agcagGAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttc < 1:3612431‑M1/150‑6 (MQ=255) agGAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggt < 1:3016898‑M1/150‑9 (MQ=255) gagaCAGCGCAACGCGCTTCCTGCCATGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttt < 1:2766195‑M1/150‑11 (MQ=255) agaCAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggtttt > 1:4033073‑M1/1‑139 (MQ=255) gaCAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttc > 1:2747236‑M1/1‑138 (MQ=255) gaCAGCACACCGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTGAAAGGGCAGCTAGCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttc < 1:2720354‑M1/150‑13 (MQ=255) aCAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttca < 1:3924136‑M1/150‑14 (MQ=255) aCAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttca < 1:2821289‑M1/150‑14 (MQ=255) aCAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttca < 1:3870062‑M1/150‑14 (MQ=255) cAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcat > 1:1861292‑M1/1‑136 (MQ=255) cAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcat > 1:1861293‑M1/1‑136 (MQ=255) cAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcat > 1:1889094‑M1/1‑136 (MQ=255) cAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcat > 1:3207187‑M1/1‑136 (MQ=255) cAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCACGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcat > 1:8504‑M1/1‑136 (MQ=255) aGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatc < 1:3283505‑M1/150‑16 (MQ=255) aGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatc < 1:4181512‑M1/150‑16 (MQ=255) cgcAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcag < 1:1928431‑M1/150‑18 (MQ=255) gcAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagt < 1:3963026‑M1/150‑19 (MQ=255) gcAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagt > 1:998123‑M1/1‑132 (MQ=255) gcAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagt > 1:3821899‑M1/1‑132 (MQ=255) gcAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagt > 1:2553145‑M1/1‑132 (MQ=255) gcAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTAATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGcattcggttttcatcagt > 1:193516‑M1/1‑132 (MQ=255) gcAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCAAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagt > 1:195018‑M1/1‑132 (MQ=255) aaCGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcc < 1:4126873‑M1/150‑21 (MQ=255) cgcgCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctg > 1:3045378‑M1/1‑128 (MQ=255) cgcgCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctg > 1:3061983‑M1/1‑128 (MQ=255) cgcgCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctg > 1:3736824‑M1/1‑128 (MQ=255) cgcTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgat < 1:1750700‑M1/150‑25 (MQ=255) tCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataaca > 1:2664416‑M1/1‑122 (MQ=255) tCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataaca > 1:2711742‑M1/1‑122 (MQ=255) tCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataaca > 1:2715794‑M1/1‑122 (MQ=255) gCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataacagtgc > 1:263024‑M1/1‑118 (MQ=255) ccAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataacagtgcg > 1:2751530‑M1/1‑117 (MQ=255) ccAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAANTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcntgataacagtgcg < 1:3745527‑M1/150‑34 (MQ=255) cAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgc < 1:1138363‑M1/150‑35 (MQ=255) cAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgc < 1:1138366‑M1/150‑35 (MQ=255) cAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgc > 1:1987780‑M1/1‑116 (MQ=255) cAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgc < 1:1138365‑M1/150‑35 (MQ=255) cAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGCGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgc < 1:3822555‑M1/150‑35 (MQ=255) ggCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGATTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcat < 1:2413034‑M1/150‑37 (MQ=255) ggCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcat > 1:1089268‑M1/1‑114 (MQ=255) ggCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcat > 1:1089270‑M1/1‑114 (MQ=255) gCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtattcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcata > 1:1008075‑M1/1‑113 (MQ=255) cGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataat > 1:3502945‑M1/1‑111 (MQ=255) gCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatg > 1:4018861‑M1/1‑110 (MQ=255) gCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatg < 1:2838637‑M1/150‑41 (MQ=255) cTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgt < 1:1241944‑M1/150‑42 (MQ=255) tttAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtga > 1:2633968‑M1/1‑107 (MQ=255) tntAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtga > 1:2633966‑M1/1‑107 (MQ=255) aaaGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacac > 1:3047008‑M1/1‑104 (MQ=255) accggtgtatcgagaCGAACGACACAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcg < 1:4352853‑M1/143‑50 (MQ=255) ggCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGtcttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtatattatgt > 1:3381084‑M1/1‑100 (MQ=255) 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gagaCGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaa > 1:826425‑M1/1‑90 (MQ=255) gaCGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCATTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaag < 1:3222155‑M1/150‑63 (MQ=255) gaCGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaag < 1:2721584‑M1/150‑63 (MQ=255) acgacgCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgc > 1:2785133‑M1/1‑83 (MQ=255) acgCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGATGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgc < 1:2578726‑M1/150‑71 (MQ=255) 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gCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacat > 1:2778856‑M1/1‑47 (MQ=255) tnGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgcgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggccttttcatacataacgc > 1:3194691‑M1/1‑42 (MQ=255) tgaAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacataacgccatt > 1:2496232‑M1/1‑38 (MQ=255) gaAATTGATGGGTTCCAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacataacgccattg > 1:1272676‑M1/1‑37 (MQ=255) gaAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacataacgccattg < 1:2883798‑M1/150‑114 (MQ=255) aaTTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacataacgccattgtg > 1:3583630‑M1/1‑35 (MQ=255) aTTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGAccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccatcgcagcggcctttttatacataacgccattgtgc < 1:2475925‑M1/150‑117 (MQ=255) | AGCAGGAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_124/2432‑2576 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |