| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_113 | 1 = | 0 (0.000) | 166 (0.870) +CACCCCAACCCGTCACTACGCA |
96/252 | 0.1 | 100% | intergenic (–/+326) | –/Xen14_04684 | –/tRNA‑Thr(ggt) |
| ? | Xen14_187 | = 464 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCGTATTCAACGTGAGAAGTGTTGATGGTGATACCACGAGCTTTTT‑CTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCGCGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTAGTGATTGCAGCGGTCAGCGTTGTTTTACCATGGT > Xen14_113/1‑148 | atgtgctcacgagtctgcggcatcgggccgtcagtcgcagcaactaccaggatcgcgccgtccatctgagcagcaccggtgatcatgtttttaacatagtctgcgtgccccgggcagtctacgtgtgcgtagtgacgggttggggtgTCg < 1:3284185‑M1/3‑1 (MQ=255)atgtgctcacgagtctgcggcatcgggccgtcagtcgcagcaactaccaggatcgcgccgtccatctgagcagcaccggtgatcatgtttttaacatagtcggcgtgccccgggcagtctacgtgtgcgtagtgacgggttggggtgTCg > 1:2452784‑M1/148‑150 (MQ=255)atgtgctcacgagtctgcggcatcgggccgtcagtcgcagcaactaccaggatcgcgccgtccatctgagcagcaccggtgatcatgtttttaacatagtcggcgtgccccgggcagtctacgtgtgcgtagtgacgggttggggtgTCg < 1:3688052‑M1/3‑1 (MQ=255)atgtgctcacgagtctgcggcatcgggccgtcagtcgcagcaactaccaggatcgcgccgtccatctgagcagcaccggtgatcatgtttttaacatagtcggcgtgccccgggcagtctacgtgtgcgtagtgacgggttggggtgTCg < 1:1449683‑M1/3‑1 (MQ=255) tgtgctcacgagtctgcggcatcgggccgtcagtcgcagcaactaccaggatcgcgccgtccatctgagcagcaccggtgatcatgtttttaacatagtcggcgtgccccgggcagtctacgtgtgcgtagtgacgggttggggtgTCGt < 1:1034911‑M1/4‑1 (MQ=255) tgtgctcacgagtctgcggcatcgggccgtcagtcgcagcaactaccaggatcgcgccgtccatctgagcagcaccggtgatcatgtttttaacatagtcggcgtgccccgggcagtctacgtgtgcgtagtgacgggttggggtgTCGt < 1:1676203‑M1/4‑1 (MQ=255) ctcacgagtctgcggcatcgggccgtcagtcgcagcaactaccaggatcgcgccgtccatctgagcagcacaggtgatcatgtttttaacatagtcggcgtgccccgggcagtctacgtgtgcgtagtgacgggttggggtgTCGTATTc < 1:3926979‑M1/8‑1 (MQ=255) tcacgagtctgcggcatcgggccgtcagtcgcagcaactaccaggatcgcgccgtccatctgagcagcaccggtgatcatgtttttaacatagtcggcgtgccccgggcagtctacgtgtgcgtagtgacgggttggggtgTCGTATTCa > 1:777306‑M1/142‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |