| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_1 | 1 = | 0 (0.000) | 37 (0.560) +CAAAATGAATCAATCTTTACTTTCT |
26/246 | 0.9 | 100% | intergenic (–/‑286) | –/Xen14_00001 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_148 | 943 = | NA (NA) | intergenic (‑46/–) | Xen14_04761/– | hypothetical protein/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAGTAAAGGT > Xen14_1/1‑150 | ccggactccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAaacctgacaagcggg < 1:1961068‑M1/82‑8 (MQ=255) gactcctttttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGAc > 1:804954‑M1/66‑150 (MQ=255) ctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAg > 1:1372142‑M1/64‑150 (MQ=255) ctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAg > 1:2769501‑M1/64‑150 (MQ=255) 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ttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAGTaaa < 1:717707‑M1/147‑1 (MQ=255) aaGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAGTAAAGGt > 1:1505629/1‑150 (MQ=255) aaGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAGTAAAGGt > 1:1505627/1‑150 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAGTAAAGGT > Xen14_1/1‑150 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |