| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_37 | = 42885 | 43 (0.430) | 34 (0.520) +GATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAG |
22/194 | 2.6 | 54.7% | noncoding (1/76 nt) | Xen14_03291 | tRNA‑Val(tac) |
| ? | Xen14_55 | = 54 | NA (NA) | intergenic (–/‑434) | –/nadA | –/Quinolinate synthase A | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAGAAATCTAGCTGGCGAGAAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAG > Xen14_37/42741‑43033 | gCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTAGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTc > 1:3741709/1‑150 (MQ=255) ggATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGt > 1:3207774/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCCTGCGACCAATGGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCGCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctg < 1:1484107‑M1/150‑13 (MQ=255) ttgtgcgACCAATTAATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatac < 1:1728782‑M1/147‑18 (MQ=255) gCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGt > 1:2617644/1‑150 (MQ=255) gCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACCGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACtt < 1:3143040/134‑1 (MQ=255) cGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAATTGGTGAGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCTACTTCGGTACTTCACATTGtt < 1:3775816/150‑1 (MQ=255) aCCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTAc < 1:3500973/150‑1 (MQ=255) ccAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACa < 1:809988/150‑1 (MQ=255) ccAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACa > 1:3045403/1‑150 (MQ=255) cAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTTGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACaa > 1:2426326/1‑150 (MQ=255) cAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGCTCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTTCTCTCCCAGCTGAGCTAACCCCCCgatactgcgctaaatactacaaacta > 1:853402‑M1/1‑124 (MQ=255) cAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaacta < 1:1236519‑M1/150‑27 (MQ=255) aaTTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactac > 1:969504‑M1/1‑123 (MQ=255) aaTTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactac > 1:969505‑M1/1‑123 (MQ=255) aTTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactact > 1:3090911‑M1/1‑122 (MQ=255) tGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCAACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactacttc > 1:3316227‑M1/1‑120 (MQ=255) gATTAAAAGTCAGCTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactacttcc > 1:786976‑M1/1‑119 (MQ=255) 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tAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAGAAATCTa > 1:979213/1‑150 (MQ=255) tAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTAGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCCCCCACTCCGGTACTTCACATTGTTACAAGAAAttta > 1:3257537/1‑147 (MQ=18) tAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTCGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactactcccacc < 1:3403641‑M1/150‑35 (MQ=255) tAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAACTAACAACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactacttccacc < 1:3671141‑M1/150‑35 (MQ=255) gaaaagGCAACTGCTCTACCAACGGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactacttccacc < 1:4037117‑M1/149‑35 (MQ=255) aaaaGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactacttccaccg > 1:719485‑M1/1‑115 (MQ=255) aaaGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAATTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAGAAATCTAGc < 1:4210381/150‑1 (MQ=255) aaaGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAGAAATCTAGc > 1:3704314/1‑150 (MQ=255) aggcaacTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGAGGACGGAATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactacttccaccgaac < 1:2338676‑M1/147‑39 (MQ=255) aGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactgcttccaccgaac < 1:1326724‑M1/150‑39 (MQ=255) gTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAGAAATCTAGCTgg > 1:1571453/1‑150 (MQ=255) gTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑GGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactacttccaccgaacc < 1:3007317‑M1/150‑40 (MQ=255) gTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAACTGAGTTAATCACCCgacactgcgctggatcttaccaactatttccaccgaacc > 1:2189678‑M1/1‑111 (MQ=255) cAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAGAAATCTAGCTGGCg > 1:1679251/1‑150 (MQ=255) cAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactacttccaccgaaccca > 1:2328123‑M1/1‑109 (MQ=255) aCTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAGAAATCTAGCTGGCgag < 1:3084878/150‑1 (MQ=255) cTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAGAAATCTAGCTGGCgaga > 1:3504953/1‑150 (MQ=255) cTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactacttccaccgaacccaccg < 1:768774‑M1/150‑45 (MQ=255) cTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCgatactgcgctggatactacaaactacttccaccgaacccaccg < 1:1015558‑M1/150‑45 (MQ=255) tGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAGAAATCTAGCTGGCGAGaa > 1:2603793/1‑150 (MQ=255) 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ccACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAGAAATCTAGCTGGCGAGAAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAg < 1:2536801/150‑1 (MQ=255) | GCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAGAAATCTAGCTGGCGAGAAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCGGTACTTCACATTGTTACAAG > Xen14_37/42741‑43033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |