| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_37 | = 42885 | 43 (0.430) | 34 (0.520) +GATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAG |
22/194 | 2.6 | 54.7% | noncoding (1/76 nt) | Xen14_03291 | tRNA‑Val(tac) |
| ? | Xen14_55 | = 54 | NA (NA) | intergenic (–/‑434) | –/nadA | –/Quinolinate synthase A | |||||
TTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_37/42747‑42885‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_55/54‑1 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTCGAGCCTGCGACCAATGGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCGCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTG < 1:1484107/150‑1 TCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTGCCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGG < 1:997084/150‑1 ttgTGCGACCAATTAATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATAC < 1:1728782/147‑1 CAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGCTCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTTCTCTCCCAGCTGAGCTAACCCCCCGATACTGCGCTAAATACTACAAACTA > 1:853402/1‑150 CAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTA < 1:1236519/150‑1 AATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTAC > 1:969505/1‑150 AATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTAC > 1:969504/1‑150 ATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACT > 1:3090911/1‑150 TGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCAACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTC > 1:3316227/1‑150 GATTAAAAGTCAGCTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCC > 1:786979/1‑150 GATTAAAAGTCAGCTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCC > 1:786976/1‑150 GATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCC < 1:1724586/150‑1 ATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATGCTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCA > 1:2888053/1‑150 ATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATAC < 1:3277241/135‑1 ATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTACCTGTCCGGGAGGTGCTCTCCCAGCTAAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATAATAAAAACTACTTCCA > 1:3046671/1‑150 gAAAAGGCAACTGCTCTACCAACGGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACC < 1:4037117/149‑1 TAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTCGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTCCCACC < 1:3403641/150‑1 TAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAACTAACAACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACC < 1:3671141/150‑1 AAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCG > 1:719485/1‑150 aggCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGAGGACGGAATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAAC < 1:2338676/147‑1 AGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTGCTTCCACCGAAC < 1:1326724/150‑1 GTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGG‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACC < 1:3007317/150‑1 GTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAACTGAGTTAATCACCCGACACTGCGCTGGATCTTACCAACTATTTCCACCGAACC > 1:2189678/1‑150 CAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCA > 1:2328123/1‑150 CTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCG < 1:768774/150‑1 CTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCG < 1:1015558/150‑1 CTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCAAACCCACCGTCg > 1:2736574/1‑149 TACCAACTGAGCTAATGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTA < 1:425513/150‑1 ACTGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGT < 1:297392/150‑1 TGAGCTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGG < 1:246695/150‑1 CTAACGACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTAACTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTCCAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCG > 1:2820579/1‑150 GACCCGA‑GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAG < 1:1026752/150‑1 gAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTC < 1:1049848/149‑1 GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAAC < 1:2891370/150‑1 GATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAC < 1:2329050/150‑1 GACGGGATTAAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGGGGTGCTCTCCCAGCTAAGCTAACCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAA < 1:2692269/150‑1 GACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAA > 1:1859462/1‑150 ACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTAGAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAAT > 1:2769610/1‑150 CGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGTGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATT < 1:1950681/150‑1 GGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGA > 1:393503/1‑150 GATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAT > 1:2046663/1‑150 ATCGAACCGCCGACCCCCTACTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTCGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCCATTGATT > 1:3261507/1‑150 GAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACACACTCCTTCCACCGCACCCACCGCCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAA > 1:1358432/1‑150 GAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAA > 1:232591/1‑150 GAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAA > 1:232592/1‑150 GAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAA > 1:1893185/1‑150 ACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCGTTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAG < 1:1992615/150‑1 GCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCA < 1:4224695/150‑1 CGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAAC < 1:1522246/150‑1 CGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAAC < 1:73856/150‑1 GACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACT > 1:1958756/1‑150 CCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGC > 1:1701228/1‑150 CCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTctacc < 1:2852116/150‑6 CTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTctacca > 1:1861858/1‑144 TTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTctaccaa > 1:3538782/1‑143 GGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTctaccaactgagc < 1:4069506/150‑14 GGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTctaccaactgagc < 1:3492713/150‑14 GGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTctaccaactgagc > 1:2969446/1‑137 CTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAG < 1:1992614/120‑1 CTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCAGTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAG < 1:1992616/120‑1 CTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACGGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAG < 1:2001819/120‑1 CTCCCACCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTGCAAACTGCTTCCACCGAACCCACCGTTATTAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCTACTGCTctac < 1:802067/131‑5 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_37/42747‑42885‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_55/54‑1 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |