| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_12 | 25 = | 991 (12.740) | 43 (0.040) | 29/280 | 1.5 | 8.4% | intergenic (–/+303) | –/Xen14_01540 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_166 | = 677 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 3177 total aligned reads displayed.
TCGTCAGCCATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_166/528‑685 | gTCAGCCATTCCGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGCATCGCTGCGACTGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTg > 1:1233771/1‑150 (MQ=255) tCAGCCATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCGTGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTgg < 1:644396/150‑1 (MQ=255) ccATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCt > 1:3102073/1‑150 (MQ=255) ttACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcg > 1:520411‑M1/1‑148 (MQ=255) tACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcgg < 1:2886076‑M1/150‑4 (MQ=255) aCGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggc < 1:2657987‑M1/150‑5 (MQ=255) cGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggca > 1:459044‑M1/1‑145 (MQ=255) gAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcag > 1:1108194‑M1/1‑144 (MQ=255) gACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcg > 1:1965276‑M1/1‑140 (MQ=255) gACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcg < 1:1510843‑M1/150‑11 (MQ=255) gctggctgATAGAGGAATACCACAATGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggta < 1:545130‑M1/150‑14 (MQ=255) gctggctgATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcaggaccggc > 1:1752745‑M1/1‑137 (MQ=255) ggctgATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAATCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatca > 1:1820625‑M1/1‑134 (MQ=255) gctgATAGAGGAATACCTCAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcag > 1:370069‑M1/1‑133 (MQ=255) 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gCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagc > 1:1705079‑M1/1‑111 (MQ=255) cGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagct > 1:1841842‑M1/1‑110 (MQ=255) gTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCtgggcctgtctgaaactggcgaaactggggcgatggcatgacagcaaac > 1:166494‑M2/1‑101 (MQ=255) gAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtga > 1:3449239‑M1/1‑106 (MQ=255) gAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtga > 1:750905‑M1/1‑106 (MQ=255) 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tggtggTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaat < 1:1444350‑M1/150‑51 (MQ=255) tggtggTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaat < 1:3065541‑M1/150‑51 (MQ=255) tggtACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaatact < 1:3359616‑M1/150‑54 (MQ=255) ggtACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaatactg > 1:1994526‑M1/1‑96 (MQ=255) gtgtgtggAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcgg > 1:1061531‑M1/2‑91 (MQ=255) aTGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaatactgacgcc < 1:821929‑M1/150‑60 (MQ=255) aTGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaatactgacgcc < 1:1896272‑M1/150‑60 (MQ=255) tgtgtgGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaatactgacgccg > 1:3755678‑M1/1‑90 (MQ=255) gtgtgGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaatactgacgccga > 1:3646220‑M1/1‑89 (MQ=255) tgtgGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaaatgacagctgtgagaaaatactgacgccgac < 1:422198‑M1/150‑63 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |