| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_12 | 25 = | 991 (12.740) | 43 (0.040) | 29/280 | 1.5 | 8.4% | intergenic (–/+303) | –/Xen14_01540 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_166 | = 677 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1080 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATC > Xen14_12/1‑174 | gcgacgctggctgatagaggaataccacaaggcgtggaaaagtggtggtacatgtgtggaatcgctgcgaatgcagacccgggataacctcgagcgcatggtggttatcaaggcgtttatcgcggtgcgggtgcTGGGCCTGTCTGAAAc > 1:440797‑M1/135‑150 (MQ=255) gtggaatcgctgcgaatgcagacccgggataacctcgagcgcatggtggttatcaaggcgtttatcgcggtgcgggtgcTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGt < 1:423839‑M1/71‑1 (MQ=255) gaaggaaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGtt < 1:2890834/135‑1 (MQ=11) gaaggaaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGtt < 1:235734/135‑1 (MQ=11) gaaggaaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCACCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGtt > 1:1235343/16‑150 (MQ=11) aaggaaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTg < 1:1572702/136‑1 (MQ=255) aggaaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGa > 1:1626946/14‑150 (MQ=255) gaaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCC‑GGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAggg > 1:2789954/12‑150 (MQ=14) aaaaccgcttccGTCACAGGTGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCACGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGAGATGGTTGAggg < 1:3128594/140‑1 (MQ=14) aaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGTTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAggg < 1:1754753/140‑1 (MQ=255) aaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAggg < 1:1074102/140‑1 (MQ=255) aaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAggg > 1:513617/11‑150 (MQ=255) aaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAggg > 1:1726640/11‑150 (MQ=255) aaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAggg > 1:1689885/11‑150 (MQ=255) aaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGt > 1:1505321/10‑150 (MQ=255) aaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGt > 1:2163803/10‑150 (MQ=255) aaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCACCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGtt > 1:1332766/9‑150 (MQ=255) accgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTa < 1:2082818/143‑1 (MQ=255) accgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATAGGGTTGAGGGTTa < 1:3417322/143‑1 (MQ=255) accgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACCTCAGGATATGGTTGAGGGTTa > 1:1474336/8‑150 (MQ=255) accgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGCAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTa > 1:2513347/8‑150 (MQ=255) cttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTg < 1:3003114/147‑1 (MQ=255) ttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTgg < 1:3441325/148‑1 (MQ=255) ttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTgg > 1:2644555/3‑150 (MQ=255) 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cGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGtga > 1:3625315/1‑150 (MQ=255) cGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGtga > 1:3210284/1‑150 (MQ=255) cGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGtga > 1:2343389/1‑150 (MQ=255) cGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCC‑GGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGtgat < 1:180445/150‑1 (MQ=255) gTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGtgat > 1:3054864/1‑150 (MQ=255) 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cacaGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGtgatga < 1:3674348/150‑1 (MQ=255) cacaGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGCTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGtgatga > 1:254805/1‑150 (MQ=255) acaGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGaa < 1:2964285/150‑1 (MQ=255) acaGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGGCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGTTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGaa < 1:3286028/150‑1 (MQ=255) caGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCa > 1:144291/1‑112 (MQ=255) caGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAg < 1:165083/150‑1 (MQ=255) caGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAg < 1:3247823/150‑1 (MQ=255) caGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAg < 1:3022496/150‑1 (MQ=255) caGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAg < 1:2283626/150‑1 (MQ=255) aGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGt < 1:2037172/150‑1 (MQ=255) aGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGt > 1:945821/1‑150 (MQ=255) 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< 1:3505147/150‑1 (MQ=255) aaaTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGAGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCC‑GGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGgaga < 1:1113077/150‑1 (MQ=255) aaTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCACGACAGCAAACGCACCGGTCGCCTCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGgaga < 1:602356/150‑1 (MQ=255) aTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCC‑GGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATc < 1:1154355/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGt < 1:3739221/110‑1 (MQ=255) tGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTctct < 1:1597190/137‑1 (MQ=255) tGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATc < 1:152511/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATc < 1:2441381/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATc < 1:8331/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGATTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATc < 1:1401985/150‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATC > Xen14_12/1‑174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |