| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | Xen14_1 | 242480 = | NA (NA) | 328 (2.990) | 107/296 | 0.0 | 73.2% | coding (66/375 nt) | Xen14_00217 | IS3 family transposase ISLad1 |
| ? | Xen14_105 | 4697 = | 120 (0.800) | coding (418/480 nt) | Xen14_04638 | IS3 family transposase ISCfr6 | |||||
Only 100 of 452 total aligned reads displayed.
GCTATCTGGCGGTTGTGATGGATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGGA > Xen14_105/4548‑4846 | gCTATCTGGCGGTTGTGATGGATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACa > 1:313260/1‑150 (MQ=255) gATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATACCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGt > 1:1172192/1‑150 (MQ=255) tttGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTat > 1:2921464/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTatc < 1:2590152/150‑1 (MQ=255) cccGCAGGGTTATCGACTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCGACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTatcatc < 1:2233120/150‑1 (MQ=255) cGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGTGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCAc < 1:550648/150‑1 (MQ=255) cGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCAc < 1:1968690/150‑1 (MQ=255) cGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCAc > 1:2373362/1‑150 (MQ=255) cTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGttt < 1:2301585/150‑1 (MQ=255) gTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCa < 1:3173036/150‑1 (MQ=255) tGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGATGCGTGGTCAACCATATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGAc > 1:41753/1‑150 (MQ=255) cgttctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTATGTTTGCTGTTTAACCAGACTgg > 1:3748384‑M2/93‑150 (MQ=255) ttctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGgtg > 1:1029648‑M2/91‑150 (MQ=255) ttctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGgtg > 1:1819494‑M2/91‑150 (MQ=255) tctcgccggacagnaggctcaccattaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGgtgt > 1:2863287‑M2/90‑150 (MQ=255) tctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGgtgt < 1:2755049‑M2/61‑1 (MQ=255) tctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGgtgt > 1:3073976‑M2/90‑150 (MQ=255) ctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGtgtg < 1:3698824‑M2/62‑1 (MQ=255) 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ctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaaccaggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGa > 1:1879176‑M2/73‑150 (MQ=255) caccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGGCTGGTGTGGTTACTGATGCAGTGAAg < 1:2268316‑M2/80‑1 (MQ=255) accatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGa < 1:2887620‑M2/81‑1 (MQ=255) accatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGa > 1:2968884‑M2/70‑150 (MQ=255) accatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGa < 1:1281350‑M2/81‑1 (MQ=255) ccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGAc < 1:2805048‑M2/82‑1 (MQ=255) ccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGAc < 1:2805038‑M2/82‑1 (MQ=255) ccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatattccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGAc > 1:858885‑M2/69‑150 (MQ=255) catgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGAcc > 1:1834111‑M2/68‑150 (MQ=255) gCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCtt > 1:819734/1‑150 (MQ=255) 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atggcatgggaaacccgtgggaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACt < 1:3582420‑M2/99‑1 (MQ=255) ggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTca > 1:525108‑M2/50‑150 (MQ=255) gcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATg > 1:1393242‑M2/49‑120 (MQ=255) gcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTcac > 1:1605496‑M2/49‑150 (MQ=255) gCCTATGAGACGCATGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTcac < 1:904685/150‑1 (MQ=255) 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acccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTtgtg < 1:646165‑M2/122‑1 (MQ=255) ccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTc > 1:1313543‑M2/27‑150 (MQ=255) ggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTAAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCt < 1:2697216‑M2/126‑1 (MQ=255) gcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTg > 1:1561606‑M2/24‑150 (MQ=255) gcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTg < 1:487525‑M2/127‑1 (MQ=255) atgttatgttCCATAGCGACAGTGATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCATTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGccc > 1:3463654/1‑150 (MQ=255) gatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGa < 1:1370892‑M2/134‑1 (MQ=255) atgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGAc < 1:3833167‑M2/135‑1 (MQ=255) atgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGAc > 1:1261146‑M2/16‑150 (MQ=255) atgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGAc < 1:3430290‑M2/135‑1 (MQ=255) tgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGAcc < 1:718184‑M2/136‑1 (MQ=255) ttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTg > 1:1642418‑M2/13‑150 (MQ=255) ttCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTg > 1:1005126/1‑150 (MQ=255) ccacagcgatAGTAATAATGCCTGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTTTCCTGCCCTGGACCTGTc < 1:2664634‑M2/140‑1 (MQ=255) ccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTc > 1:3674728‑M2/11‑150 (MQ=255) ccATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGATTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTc < 1:1479951/150‑1 (MQ=255) acagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACTAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCgg < 1:70048‑M2/142‑1 (MQ=255) acagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCgg < 1:2784249‑M2/142‑1 (MQ=255) agcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGtt < 1:3486611‑M2/144‑1 (MQ=255) agcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGtt < 1:3151965‑M2/144‑1 (MQ=255) gCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTg < 1:934928/150‑1 (MQ=255) cgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGc < 1:1356910‑M2/146‑1 (MQ=255) atAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCg < 1:132812‑M2/148‑1 (MQ=255) atAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGCGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCg < 1:2635784‑M2/148‑1 (MQ=255) tAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCgg > 1:567196‑M2/2‑150 (MQ=255) cAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCgg < 1:99033/150‑1 (MQ=255) aGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGGGTGAGTACTGATGCAGTTAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGGa < 1:3804921/150‑1 (MQ=255) | GCTATCTGGCGGTTGTGATGGATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGGA > Xen14_105/4548‑4846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |