| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Xen14_105 | 4697 = | 120 (0.800) | coding (418/480 nt) | Xen14_04638 | IS3 family transposase ISCfr6 | |||||
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_1/242556‑242480‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGG > Xen14_105/4697‑4845 cgttctcgccggacaGCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCCGTTTGCTGTTTAACCAGACTGG > 1:1574520/16‑150cgttctcgccggacaGCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTATGTTTGCTGTTTAACCAGACTGG > 1:3748384/16‑150 gttctcgccggacaGCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGT > 1:1599109/15‑150 gttctcgccggacaGCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGT > 1:1462035/15‑150 ttctcgccggacaGCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTG < 1:1788478/137‑1 ttctcgccggacaGCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTG > 1:1029648/14‑150 ttctcgccggacaGCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTG > 1:2499649/14‑150 ttctcgccggacaGCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTG 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1:718184/150‑1 TGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACC < 1:3198697/150‑1 TGTTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACC > 1:603392/1‑150 TTCCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTG > 1:1322404/1‑150 CCACAGCGATAGTAATAATGCCTGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTTTCCTGCCCTGGACCTGTC < 1:2664634/150‑1 CCACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTC < 1:1182777/150‑1 ACAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGG < 1:2784249/150‑1 CAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTCCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGT < 1:1262468/150‑1 CAGCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACGCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGT < 1:3751789/150‑1 GCGATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGGTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTG < 1:2706964/150‑1 ATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACTTTCCCGCGTCCTAATTCACACAGCGATTGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCG < 1:2730417/150‑1 ATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCGTCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCG < 1:344626/150‑1 ATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCtg < 1:13618/150‑3 ATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCG < 1:3005314/150‑1 ATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCG < 1:132815/150‑1 ATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGCGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCG < 1:2635781/150‑1 ATAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTAGCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCG < 1:3715182/150‑1 TAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGG > 1:567196/1‑150 TAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGG > 1:1392206/1‑150 TAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGG > 1:3364926/1‑150 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCAGGCTCACCATGAAAGCGCTGGAAATGGCATGGGAAACCCGTGGTAAACCCGGCGGGGTGATGTTCCACAGCGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_1/242556‑242480‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGG > Xen14_105/4697‑4845 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |